基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法

摘要

本发明公开了一种基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，包括如下步骤：虚拟酶解蛋白质数据库序列，根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引，根据待分析实验图谱中母离子去电荷后的质量数在建立的肽段数据库中找出符合要求的候选肽段，进行去同位素峰和选取有效峰处理，产生符合候选肽段理论图谱的实验标记图谱，统计不同离子的质量误差信息，计算出不同离子类型在不同区间内的质荷比误差识别能力，对每个候选肽段基于质荷比误差识别能力进行打分，选择得分最高的肽段作为此实验图谱的鉴定结果，对鉴定结果进行整体质量控制。该方法鉴定的有效图谱数量和肽段数量均高于目前算法，且可动态选峰，运行速度快。

主权项

一种基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)虚拟酶解蛋白质数据库序列，并根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引；(2)根据待分析实验图谱中母离子去电荷后的质量数在步骤(1)所述的肽段数据库中找出符合要求的候选肽段；(3)对待分析实验图谱进行去同位素峰和选取有效峰处理；(4)产生符合候选肽段理论图谱的实验标记图谱；(5)统计不同离子的质量误差信息，并计算出不同离子类型在不同区间内的质荷比误差识别能力；(6)对每个候选肽段基于质荷比误差识别能力进行打分，选择得分最高的肽段作为此实验图谱的鉴定结果，并对鉴定结果进行整体质量控制。