以相对位能差预测蛋白质热稳定之方法

摘要

本发明系有关于以相对位能差预测蛋白质热稳定之方法，其系提供一运算平台供使用者输入蛋白质名称或简写，即可检索并提供可能具热稳定的突变胺基酸序列，并运算、比较该突变胺基酸序列具热稳定的可能性，作为该蛋白质热稳定研究之参考，亦系以蛋白质相对位能之运算，预测点突变后的蛋白质有无热稳定性之方法，而具有操作简单、降低研发成本之优点。

主权项

一种以相对位能差预测蛋白质热稳定之方法，系包括下列步骤：A、输入名称；于一操作电脑上执行一人机介面软体，并进行一蛋白质名称输入作业；系于所述操作电脑输入一蛋白质的全名或缩写；B、序列检索；于所述的操作电脑或一远端电脑，进行一蛋白质序列检索作业；系将所述的蛋白质的全名或缩写，与一蛋白质序列资料库进行比对，并得一蛋白质序列比对结果；C、二次检索；于所述的操作电脑或一远端电脑，以所述的蛋白质序列比对结果，进行复数个二次检索作业；系包括：C1、检索三维结构模版；于所述的操作电脑或一远端电脑，以所述的蛋白质序列比对结果，与一蛋白质三维结构资料库进行比对，并输出至少一蛋白质三维结构模版；C2、检索活性区域；于所述的操作电脑或一远端电脑，以所述的蛋白质序列比对结果，与一蛋白质活性区域资料库进行比对，并输出至少一避开蛋白质活性区域；C3、检索磷酸化调控区；于所述的操作电脑或一远端电脑，以所述的蛋白质序列比对结果，与一蛋白质磷酸化调控区资料库进行比对，并得一避开蛋白质磷酸化调控区；C4、显示检索结果；将所述的蛋白质三维结构模版、所述的避开蛋白质活性区域、所述的避开蛋白质磷酸化调控区，回传至所述的操作电脑，而由所述的人机介面软体显示；D、建议具热稳定突变序列；于所述的操作电脑或一远端电脑，藉由执行一蛋白质热稳定序列建议软体，而进行一具热稳定突变序列之建议作业；系将所述的避开蛋白质活性区域与所述的避开蛋白质磷酸化调控区，以所述的蛋白质热稳定序列建议软体比对而避开，并输出至少一建议之具热稳定突变序列，且由所述的人机介面软体显示；E、三维结构模拟；于所述的操作电脑或一远端电脑，藉由执行一蛋白质三维结构模拟软体，而进行一蛋白质三维结构模拟作业；系藉由所述的蛋白质三维结构模拟软体，将所述的蛋白质三维结构比对结果与所述的建议之具热稳定突变序列进行模拟作业，系包括：E1、运算△△G；所述的蛋白质三维结构比对结果之△△G运算作业；系将所述的蛋白质三维结构比对结果以一△△G运算软体进行运算作业，并输出所述的蛋白质三维结构比对结果之一△△G；E2、比较△△G；所述的蛋白质三维结构比对结果之△△G比较作业；系将所述的蛋白质三维结构比对结果之△△G与一△△G运算结果资料库之资料对应比较，判定相同即输出一对应△△G之热稳定性百分比；E3、显示热稳定性百分比；显示所述的蛋白质三维结构比对结果之热稳定性百分比；系将所述对应△△G之热稳定性百分比，确认并回传至所述的操作电脑，而由所述的人机介面软体显示。