高解析度分析核酸以检测序列变异的系统和方法

摘要

本发明提供了用于检验生物样品中具有药物抗性和/或药物敏感性表型的微生物的方法，其中该方法能够检测与已知和/或未知突变相关的抗性和敏感性表型。在一些方面，提供了用于检测药物抗性结核分枝杆菌（MTb）包括多药物抗性MTb的方法，其中药物抗性与一种或多种新型突变相关。还提供了与这样的方法相关的系统、试剂盒和组合物。

主权项

一种扩增方法，该方法包括：获得包含一个或多个DNA片段的样品；从一个或多个DNA片段确定靶核酸序列；以使寡核苷酸引物的熔解温度和靶核酸序列的熔解温度之间的温度范围最小化的方式用与变性曲线（TD）或靶核酸序列重叠的退火曲线（TA）确定一对寡核苷酸引物；和采用一对寡核苷酸引物扩增靶核酸序列，并使温度在等于或大于寡核苷酸引物的熔解温度和靶核酸序列的熔解温度之间的温度范围内循环。