一种SLC22A1基因多态性检测特异性引物和液相芯片

摘要

本发明公开了一种SLC22A1基因检测液相芯片和特异性引物，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对C117T位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20；针对T198C位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22；针对C86T位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24；针对C97G位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26；针对C164T位点的SEQ ID NO.27及SEQID NO.28；针对G123T位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30；针对G127A位点的SEQ IDNO.31及SEQ ID NO.32；针对A148G位点的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34；和/或针对G129C位点的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

主权项

一种SLC22A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有：（A）.针对SLC22A1基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对C117T位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20；针对T198C位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22；针对C86T位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24；针对C97G位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26；针对C164T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28；针对G123T位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30；针对G127A位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32；针对A148G位点的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34；和/或针对G129C位点的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.18；（B）.有anti‑tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.37～SEQ ID NO.54，且所述anti‑tag序列能相应地与（A）中所选的tag序列互补配对；（C）.用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物；所述扩增引物为：针对C117T、T198C位点的SEQ ID NO.55及SEQ ID NO.56；针对C86T、C97G位点的SEQ ID NO.57及SEQ ID NO.58；针对C164T位点的SEQ ID NO.59及SEQ ID NO.60；针对G123T位点的SEQ ID NO.61及SEQ ID NO.62；针对G127A、A148G位点的SEQ ID NO.63及SEQ ID NO.64；和/或针对G129C位点的SEQ ID NO.65及SEQ ID NO.66。