发明名称 一种基于遗传背景的鱼类亲本选择系统及方法
摘要 一种基于遗传背景的鱼类亲本选择系统及方法,属于利用分子生物学DNA分子标记进行鱼类繁殖时亲本选择的数据分析技术领域。本发明解决了现有基于遗传背景的分析过程复杂、需要多个处理工具配合实现的问题。所述亲本选择系统包括数据转换装置、格式转换装置、构建聚类树装置、遗传距离计算装置、近交系数计算装置、亲缘系数计算装置、群体繁殖亲本选择装置、家系繁殖亲本选择装置、家系繁殖组合装置和群体繁殖组合装置。所述亲本选择方法包括数据转换、格式转换、构建聚类树、遗传距离计算、近交系数计算、亲缘系数计算、群体繁殖亲本选择、家系繁殖亲本选择、家系繁殖组合和群体繁殖组合的步骤。本发明适用于对鱼类繁殖时亲本选择技术领域。
申请公布号 CN103942466A 申请公布日期 2014.07.23
申请号 CN201410198287.3 申请日期 2014.05.12
申请人 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 发明人 匡友谊;佟广香;郑先虎;孙效文
分类号 G06F19/10(2011.01)I 主分类号 G06F19/10(2011.01)I
代理机构 哈尔滨市松花江专利商标事务所 23109 代理人 张宏威
主权项 一种基于遗传背景的鱼类亲本选择系统,其特征在于,所述装置由以下部分组成:格式转换装置,用于常用群体遗传学分析软件输入数据格式转换;构建聚类树装置,用于利用分子标记数据采用phylip软件构建个体间聚类树;遗传距离计算装置,用于利用分子标记数据采用phylip软件进行个体间的遗传距离计算;近交系数计算装置,用于利用分子标记数据进行个体的近交系数计算;亲缘系数计算装置,用于利用分子标记数据进行个体间的亲缘系数计算;群体繁殖亲本选择装置,用于利用分子标记数据进行基于亲缘系数的群体繁殖亲本选择;家系繁殖亲本选择装置,用于利用分子标记数据、个体的性别数据进行基于亲缘系数的家系繁殖亲本选择;家系繁殖组合装置,用于利用分子标记数据、个体的性别数据、个体聚类树数据进行遗传距离聚类树结合亲缘系数评估的家系繁殖亲本组合;群体繁殖组合装置,用于利用分子标记数据、个体的性别数据、个体聚类树数据进行遗传距离聚类树结合亲缘系数进行群体繁殖组合。
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