慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针和引物、及其试剂盒

摘要

本发明提供了慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针和引物、及其试剂盒。本发明的慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物，包括单核苷酸多态性位点rs2891168的特异性扩增引物对、单核苷酸多态性位点rs1800796的特异性扩增引物对、单核苷酸多态性位点rs2891168的检测探针，以及单核苷酸多态性位点rs1800796的检测探针。本发明还进一步提供了采用所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物制备的试剂盒。本发明的探针、引物及试剂盒特别适用于汉族人群慢性牙周炎的单核苷酸多态性研究。

主权项

一种慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用试剂盒，包括：单核苷酸多态性位点rs2891168的特异性扩增引物对：上游引物核苷酸序列为SEQ ID NO:1，下游引物核苷酸序列为SEQ ID NO:2；单核苷酸多态性位点rs1800796的特异性扩增引物对：上游引物核苷酸序列为SEQ ID NO:3，下游引物核苷酸序列为SEQ ID NO:4；单核苷酸多态性位点rs2891168的检测探针：包括核苷酸序列为SEQ ID NO:5的5’端野生型探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:6的5’端突变型探针以及核苷酸序列为SEQ ID NO:7的3’端common探针；单核苷酸多态性位点rs1800796的检测探针：包括核苷酸序列为SEQ ID NO:8的5’端野生型探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:9的5’端突变型探针以及核苷酸序列为SEQ ID NO:10的3’端common探针；基因芯片，所述基因芯片的基片表面不同位置分别固定有rs2891168野生型Zip探针、rs2891168突变型Zip探针、rs1800796野生型Zip探针及rs1800796突变型Zip探针；所述rs2891168的3’端common探针及rs1800796的3’端common探针末端携带荧光基团，所述rs2891168的5’端野生型探针、rs2891168的5’端突变型探针、rs1800796的5’端野生型探针及rs1800796的5’端突变型探针末端分别连接有与rs2891168野生型Zip探针、rs2891168突变型Zip探针、rs1800796野生型Zip探针及rs1800796突变型Zip探针序列互补的cZip寡核苷酸片段；所述rs2891168野生型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:11，rs2891168突变型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:12、rs1800796野生型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:13，rs1800796突变型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:14；所述单核苷酸多态性位点rs2891168的检测探针中，末端带cZip的5’端野生型探针序列为SEQ ID NO:21、末端带cZip的5’端突变型探针的序列为SEQ ID NO:22；所述单核苷酸多态性位点rs1800796的检测探针中，末端带cZip的5’端野生型探针序列为SEQ ID NO:23，末端带cZip的5’端突变型探针的序列为SEQ ID NO:24。