利用长定序片段重组核酸序列之系统及其方法;SYSTEM AND METHOD FOR ASSEMBLING NUCLEIC ACID SEQUENCE USING LONG READS

摘要

本发明提供一种利用复数个长定序片段重组一核酸序列之方法，其系应用于一电脑系统中，而那些长定序片段储存于电脑系统中。此方法包含先进入电脑系统读取那些长定序片段，并决定一预设跳跃间距及一预设比对长度。比对那些长定序片段，若那些长定序片段之间具有预设比对长度之一共有序列，则依据前述的预设跳跃间距朝一预设方向跳跃。重覆此比对与跳跃步骤直到达到那些长定序片段序列其中之一的末端为止；若比对出的那些共有序列之数量大于一阀值，则判断那些长定序片段之那些共有序列系重叠。最后将具有那些共有序列之那些长定序片段重组成核酸序列。