发明名称 一种分析微藻代谢组的方法
摘要 本发明公开了一种分析微藻代谢组的方法,该方法包括:微藻细胞收集及淬灭;提取细胞内代谢物;代谢物衍生化;最后通过GC-MS对样品分析得到代谢组结果。本发明提供了一种分析微藻代谢组的手段,这种手段涉及代谢反应的终止、代谢物的提取、代谢物的分析,从而获得微藻在不同培养条件下的代谢物的定性和定量结果,为微藻代谢组的分析提供了方法,这种方法对促进微藻的代谢研究具有重要的意义。
申请公布号 CN102495152B 申请公布日期 2014.07.02
申请号 CN201110384769.4 申请日期 2011.11.28
申请人 天津大学 发明人 元英进;陆姝欢;丁明珠;牛艳红
分类号 G01N30/02(2006.01)I;G01N30/06(2006.01)I 主分类号 G01N30/02(2006.01)I
代理机构 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 代理人 陆艺
主权项 一种分析微藻代谢组的方法,其特征是包括如下步骤:(1)微藻细胞收集及淬灭:取出已培养好的微藻藻液样品3‑5份,每份100‑150mL,4℃下3000‑5000rpm,离心3‑4min,收集下层的细胞,用3‑5mL代谢终止液在‑40℃下淬灭5‑10分钟,终止代谢反应,在‑80℃下冷冻干燥4‑6h获得冻干细胞;所述代谢终止液为含有1500mg·L<sup>‑1</sup>NaNO<sub>3</sub>,36mg·L<sup>‑1</sup>CaCl<sub>2</sub>·2H<sub>2</sub>O,75mg·L<sup>‑1</sup>MgSO<sub>4</sub>·7H<sub>2</sub>O和40mg·L<sup>‑1</sup>K<sub>2</sub>HPO<sub>4</sub>·3H<sub>2</sub>O的甲醇水溶液,所述甲醇水溶液中甲醇和水的体积比为1:2;(2)提取细胞内代谢物:从步骤(1)获得的3‑5份冻干细胞中各取15‑25mg分别置于离心管中,每管加入‑40℃的代谢提取液1‑2mL,混匀,盖紧并放入液氮中,反复冻融3‑5次,在‑20℃下4000‑6000rpm离心1‑2min,收集上清,另向残渣中加入0.5‑1mL代谢提取液,‑20℃下4000‑6000rpm离心1‑2min,离心后,将两次上清液合并,加入10‑20μg氘标记琥珀酸,得混合液,各取200μL混合液,在‑80℃下冷冻干燥2‑4小时;所述代谢提取液为体积百分含量为50%的甲醇水溶液;(3)代谢物衍生化向步骤(2)获得的样品中各加入20mg·mL<sup>‑1</sup>的甲氧基胺盐酸盐的吡啶溶液50μL,于40℃水浴中反应60‑80min,反应结束后加入80μL N‑甲基‑N‑三甲基硅基三氟乙酰胺,于40℃水浴再反应60‑80min,8000‑12000rpm离心1min,取上清100μL放入已编号的GC进样瓶,室温放置2h;(4)GC‑MS检测采用GC‑MS对步骤(3)获得的3‑5份样品进行定性和定量处理,得到微藻代谢组分析结果;所述步骤(4)的检测条件如下:色谱柱:DB‑5气相色谱柱,其规格为30m*0.25mm,0.25μm;进样量:1μL;分流比:10:1;进样口温度:280℃;GC interface温度:270℃;氦气流速:恒压,91KPa;升温程序:70℃保持2min,以5℃·min<sup>‑1</sup>的速度升到290℃,并在290℃保持6min;电离电压:70eV;源温:250℃;扫描范围:50‑800m/z;扫描速度:2scan·s<sup>‑1</sup>。
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