栉孔扇贝TGF-β I型受体基因及其SNP位点

摘要

本发明涉及分子遗传标记技术中栉孔扇贝TGF-β超家族I型受体基因Tgfbr1的克隆，基因中与闭壳肌重量相关SNP位点的筛查分型技术，及其在高产扇贝选育中应用的方法。利用同源克隆的策略获得栉孔扇贝Tgfbr1基因的全长cDNA序列；通过blastn比对发现一个单核苷酸多态性SNP位点，针对该位点设计引物和探针，采用高分辨率熔解曲线技术在一个栉孔扇贝自然群体中进行SNP分型，并测量每个体的闭壳肌重。统计分析显示位点c.1815C>T与栉孔扇贝闭壳肌重显著相关，TT型个体的闭壳肌重显著高于CC 和CT型个体。在高产栉孔扇贝的选择育种过程中，可对栉孔扇贝育种候选群体进行位点c.1815C>T分型，结合其它与生长性状相关位点的分型信息，优先选择位点c.1815C>T为TT型的个体作为育种亲本。

主权项

一种用于检测与栉孔扇贝闭壳肌重量相关的SNP位点的探针和引物，其序列信息如下：探针序列为SEQ ID NO:3；上游引物序列为SEQ ID NO:4；下游引物序列为SEQ ID NO:5；所述的SNP位点为核苷酸序列为SEQ ID NO:1的TGF‑βI型受体基因的1830位，其碱基为C或T。