发明名称 可裂解连接单元及其合成方法与用途
摘要 本发明公开了一种可裂解连接单元及其合成方法与用途。可裂解连接单元的结构式为:<img file="2011103316591100004DEST_PATH_IMAGE001.GIF" wi="217" he="55" />,其中,n为1或2,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数。该可裂解连接单元可用于DNA合成测序。与现有技术相比,本发明的化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成;该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接;通过研究该类化合物的裂解性能,发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的完全裂解,可应用于DNA测序。
申请公布号 CN102516208B 申请公布日期 2014.06.18
申请号 CN201110331659.1 申请日期 2011.10.27
申请人 上海交通大学;华东理工大学;深圳华因康基因科技有限公司 发明人 沈玉梅;龚兵;黎庆;邵志峰;伍新燕;盛司潼;郭勋祥
分类号 C07D307/20(2006.01)I;C07D309/10(2006.01)I;C08G65/00(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C07D307/20(2006.01)I
代理机构 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 代理人 郭国中
主权项 1.一种可裂解连接单元的合成方法,其特征在于,所述可裂解连接单元结构式为: <img file="FDA0000456304500000011.GIF" wi="710" he="174" />其中,n为1,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数; 所述合成方法包括以下合成步骤: a、化合物T-1的合成:以L-谷氨酸为原料,加入盐酸,在冰浴搅拌下滴加亚硝酸钠溶液,滴加完毕后,继续在冰浴下反应3~5h,然后移至室温下过夜;反应结束后,减压蒸去水,加入乙酸乙酯溶解,过滤,滤液用无水硫酸钠干燥,过滤,旋干溶剂得化合物T-1<img file="FDA0000456304500000012.GIF" wi="325" he="188" />b、化合物T-2的合成:取化合物T-1,以无水四氢呋喃做溶剂,氮气保护,在冰水浴下缓慢滴加硼烷/二甲硫醚溶液,滴加完毕后,继续在室温下反应4~5h;反应结束后,加入甲醇淬灭反应,旋去溶剂,再加入甲醇,旋干得化合物T-2<img file="FDA0000456304500000013.GIF" wi="327" he="140" />c、化合物T-3的合成:取化合物T-2,以二氯甲烷做溶剂,加入咪唑,氮气保护下和二甲基叔丁基氯硅烷在室温下反应17~20h;反应结束后,加入二氯甲烷稀释,分别用2mol/L盐酸、水和饱和碳酸氢钠洗涤反应液,无水硫酸钠干燥,旋干,柱层析得化合物T-3纯品<img file="FDA0000456304500000014.GIF" wi="360" he="140" />d、化合物T-4的合成:以二氯甲烷做溶剂,化合物T-3在氮气保护及冰盐浴下和二异丁基氢化铝反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,加入0.2mol/L HCl淬灭反应,二氯甲烷萃取,有机相用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,旋转蒸发除去溶剂得化合物T-4<img file="FDA0000456304500000015.GIF" wi="387" he="140" />e、化合物T-5的合成:以二氯甲烷做溶剂,化合物T-4在氮气保护和冰盐浴下,加入三乙胺,然后和甲磺酰氯反应30~50min,在40~50℃回流3~5h,反应结束后,二氯甲烷稀释,水洗,无水硫酸钠干燥,旋干,柱层析得化合物T-5<img file="FDA0000456304500000016.GIF" wi="309" he="143" />f、化合物T-6的合成:以二氯甲烷做溶剂,化合物T-5在对甲苯磺酸吡啶盐作用下和原料A在室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,旋干溶剂,加入水,用乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤有机相,无水硫酸钠干燥,过滤,旋干,柱层析得到化合物T-6纯品<img file="FDA0000456304500000021.GIF" wi="676" he="146" />所述原料A的结构式为:<img file="FDA0000456304500000022.GIF" wi="412" he="137" />其中,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数;g、化合物T-7的合成:以四氢呋喃做溶剂,在四丁基氟化胺作用下,化合物T-6在室温下脱羟基保护,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,旋干溶剂,柱层析得到化合物T-7<img file="FDA0000456304500000023.GIF" wi="621" he="149" />h、化合物T-8的合成:把化合物T-7溶于过量的氨水,室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,加乙醇,减压旋去溶剂,得化合物T-8<img file="FDA0000456304500000024.GIF" wi="660" he="144" />即所述可裂解连接单元。
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