发明名称 序列校正方法与序列校正装置
摘要 本发明提供一种序列校正的方法,包括:(a)藉由一接收单元,获得来自一相同来源的一第一读出序列与一第二读出序列;(b)藉由一测定单元,设定一比较条件;(c)藉由该测定单元,根据该比较条件比较该第一读出序列与该第二读出序列以产生一序列比较结果;以及(d)藉由该测定单元,根据该序列比较结果输出一校正序列,其中该比较条件系根据该第一读出序列之一第一序列子集目录与该第二读出序列之一第二序列子集目录来设定。
申请公布号 CN102686740B 申请公布日期 2014.06.18
申请号 CN201080041764.5 申请日期 2010.12.23
申请人 财团法人工业技术研究院 发明人 黄百纲;范振业;潘诏智
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 北京市柳沈律师事务所 11105 代理人 陈小雯
主权项 一种序列校正装置,包括:一接收装置,其被设置用以获得来自一相同来源的一第一读出序列与一第二读出序列;以及一测定装置,其被设置用以执行包括下列之步骤:(a)设定一比较条件;(b)根据该比较条件比较该第一读出序列与该第二读出序列以产生一序列比较结果;以及(c)根据该序列比较结果输出一校正序列,其中该比较条件系根据该第一读出序列之一第一序列子集目录与该第二读出序列之一第二序列子集目录来设定,其中该第一读出序列的该第一序列子集目录包括复数个具有一特定长度的第一序列子集,该复数个第一序列子集构成复数个具有不同序列子集起始位置的第一序列子集组,且该第二读出序列的该第二序列子集目录包括复数个具有一特定长度的第二序列子集,该复数个第二序列子集构成复数个具有不同序列子集起始位置的第二序列子集组,且其中该第一序列子集目录之该第一序列子集的该特定长度与该第二序列子集目录之该第二序列子集的该特定长度为相同之特定长度,又其中该步骤(b)包括:比较该第一序列子集目录与该第二序列子集目录以产生共同片段与非共同的区域,其中一个共同片段由至少一个共同的序列子集所构成且无间断的介于两个非共同的区域之间,又该共同片段越长,则包含于其中之该共同的序列子集的数量越多,且其中藉由比较该第一序列子集目录与该第二序列子集目录所产生的所有共同片段形成一共同片段组合;测定该共同片段组合对该第一读出序列或该第二读出序列的一覆盖率;以及当该覆盖率的值满足一预定值时,自该共同片段组合产生该序列比较结果。
地址 中国台湾新竹县