发明名称 一种玉米青枯病原镰刀菌对玉米苗期致病性的检测方法
摘要 一种玉米青枯病原镰刀菌对玉米苗期致病性的检测方法,其监测方法包括感染玉米青枯病源镰刀菌玉米的制备、引物设计及合成、感染玉米青枯病源镰刀菌玉米DNA的提取、目的基因的扩增及分离和扩增终产物的分离、进行测序鉴定,并在基因库Genbank进行比对,确定为玉米上感染玉米青枯病源镰刀菌,本发明一种玉米青枯病源镰刀菌对玉米苗期致病性的检测方法,其鉴定方法操作简单,鉴定结果迅速准确,可以应用到实际生产中。
申请公布号 CN102586428B 申请公布日期 2014.06.11
申请号 CN201210009632.5 申请日期 2012.01.13
申请人 河南科技大学 发明人 侯军;胡梅;林晓民;张建祥;陈根强;韩文忠
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 洛阳公信知识产权事务所(普通合伙) 41120 代理人 苗强
主权项 一种玉米青枯病原镰刀菌对玉米苗期致病性的检测方法,其特征在于,所述的检测方法为:步骤一、水‑琼脂混合培养基的制备1)在1000mL水中加入17g琼脂,加热使琼脂溶解,后加入1.5g的硝酸钙、1.5g的硝酸钾、1g的磷酸二氢铵和0.5g的硫酸镁,搅拌均匀,形成混合液,分装于300mL三角瓶中,每瓶100mL,丙烯膜封口,并留有排气孔,然后将每一个含有混合液的三角瓶送入高压灭菌锅内,在压强为0.14MPa,温度为121℃,灭菌30分钟,制得营养琼脂培养基,备用;2)在无菌条件下,将步骤1)中每一个灭菌后的营养琼脂培养基中加入100mL的去离子水,然后将营养琼脂培养基搅碎至粒径为0.5‑‑0.8cm的颗粒时止,混合均匀,形成水‑琼脂混合培养基,备用;步骤二、玉米苗培养按重量份数取1份粒径为0.8mm的玉米和2份浓度为0.1%的汞,将玉米在汞中浸泡10分钟,取出,用去离子水洗涤3次,然后将洗涤后的玉米放到底层铺有无菌滤纸的培养容器中,后在培养容器内加入无菌去离子水,去离子水的加入量淹没滤纸时止,后将培养容器送入25℃的培养箱内,培养3‑4天待玉米发芽后,将玉米芽移植到水‑琼脂混合培养基中,25℃‑30℃条件下,见光培养,备用;步骤三、镰刀菌接种菌液制备与接种1)在100mL的去离子水中加入20g的马铃薯片,煮20‑30分钟,过滤,得到滤液,后在滤液中加入2g的葡萄糖,混合均匀,然后用去离子水定容至100mL止,制得马铃薯液体培养基,备用;2)在无菌条件下,在马铃薯液体培养基中接入一个玉米青枯病原镰刀菌种,送入摇床上,在25℃条件下,发酵培养4‑6天,形成玉米青枯病原镰刀菌培养菌液,然后在玉米青枯病原镰刀菌培养菌液中加入磁力搅拌器,转速为150转/分钟,搅拌160‑200分钟,使整个菌液呈糊状并能用玻璃吸管定量吸入状态,后继续培养24小时,形成镰刀菌接种菌液,备用;3)玉米幼苗生长至丙烯膜处,在丙烯膜上开一个玉米生长口,待玉米生长至4‑5片叶子时止,在无菌条件下,向培养玉米的三角瓶内加入5‑6mL步骤2)中得到的镰刀菌接种菌液,25‑30℃条件下,见光培养10天,得到感染玉米青枯病原镰刀菌的玉米,备用;步骤四、对感染玉米青枯病原镰刀菌的玉米进行检测1)取直径为2cm的感染玉米青枯病原镰刀菌玉米的根部及茎部,洗净,然后在研钵内加入1g感染玉米青枯病原镰刀菌玉米的根部及茎部、0.5mL的TE溶液、0.5mL的SDS溶液和2g的石英砂,研磨均匀,得到物料,备用;2)将步骤1)中得到的物料全部转入5mL离心管内,在65℃条件下放置10分钟,后加入600μL浓度为7.5mol/L的乙酸铵溶液,置于0℃条件下,放置8分钟,取出,将含有物料的5mL离心管送入离心机内,以转速为12000转/分钟,离心5分钟,得到上清液Ⅰ,在1.5mL离心管a内加入500μL的上清液Ⅰ、50μL浓度为3mol/L的NaAc和300μL的异丙醇,混合均匀,形成混合液Ⅰ,将含有混合液Ⅰ的1.5mL离心管a置于0℃条件下,放置8分钟,取出,后将含有混合液Ⅰ的1.5mL离心管a送入离心机内,以转速为13000转/分钟,离心10分钟,得到1.5mL离心管a底部的沉淀,备用;3)在含有沉淀的1.5mL离心管a内加入200μL的TE溶液,将沉淀溶解,后加入5μL的RNase酶,混合均匀,后置于65℃条件下,放置10分钟,再加入200μL的氯仿‑异戊醇混合液,混合均匀,形成混合液Ⅱ,将含有形成混合液Ⅱ的1.5mL离心管a送入离心机内,以转速为12000转/分钟,离心5分钟,得到上清液,在1.5mL离心管b中加入500μL的上清液Ⅱ、50μL浓度为3mol/L的NaAc和300μL的异丙醇,混合均匀,形成混合液Ⅲ,将含有混合液Ⅲ的1.5mL离心管b送入离心机内,以转速为12000转/分钟,离心10分钟,得到沉淀,备用;4)用浓度为70%的乙醇对步骤3)中1.5mL离心管b内的沉淀洗涤1次,待乙醇挥发完毕后,在1.5mL离心管b内加入25μL的TE溶液,混合均匀,形成DNA模板,备用;5)真菌ITS通用引物上游引物:5ˊ‑TCCGTAGGTGAACCTGCGG‑3ˊ下游引物:5ˊ‑TCCTCCGCTTATTGATATGC‑3ˊ6)在0.5ml离心管Ⅰ内加入2μL步骤4)中得到的DNA模板、4.0μL的10倍缓冲液、1μL的dNTP、1μL的上游引物、1μL的下游引物、1μL的Taq聚合酶和40.0μL的去离子水,混合均匀,得到混合液Ⅳ,备用;7)将含有混合液Ⅳ的0.5ml离心管Ⅰ放入基因扩增仪中,进行PCR扩增,PCR扩增程序为:94℃预变性5分钟,94℃变性45秒,55℃退火45秒,72℃延伸100秒,变性、退火和延伸为一次循环,共35次循环,后72℃再次延伸10分钟,取出,得到扩增产物,备用;8)利用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,在凝胶成像系统中确认扩增产物中含有551bp的目的条带,备用;9)用DNA凝胶回收试剂盒对扩增产物进行回收、纯化取1.5ml离心管c并称其重量,在紫外灯下将扩增产物从步骤8)中的凝胶上切下,将切下的扩增产物放在已称重的1.5ml离心管c中,称取1.5ml离心管c的总重并计算出从凝胶上切下来的扩增产物的重量,然后将1.5ml离心管c中的扩增产物捣碎,按扩增产物的克数加入相同毫升数的DNA纯化结合液,混合均匀,将1.5ml离心管c放置在50ºC水浴中加热至扩增产物完全融解,得到混合液Ⅴ,将混合液Ⅴ加到DNA纯化柱上,DNA纯化柱位于收集管中,收集管在21℃条件下放置1分钟,将收集管放入离心机中,转速为12000转/分钟,离心1分钟后,取出含有沉淀物的DNA纯化柱<b>,</b>倒掉收集管内的液体,向DNA纯化柱上加入700微升的洗涤液,将DNA纯化柱置于收集管内,后将收集管在21℃条件下放置1分钟,后将收集管放入离心机中,转速为12000转/分钟,离心1分钟后,取出含有沉淀物的DNA纯化柱<b>,</b>倒掉收集管内的液体,向DNA纯化柱上加入500微升的洗涤液,将DNA纯化柱置于收集管内,放入离心机中,转速为12000转/分钟,离心1分钟后,取出含有沉淀物的DNA纯化柱<b>,</b>倒掉收集管内的液体,将DNA纯化柱置于收集管内,然后将收集管放入离心机内,转速13000转/分钟,离心1分钟,取出DNA纯化柱放置于1.5ml离心管d中,后在DNA纯化柱上加入40微升洗脱液,将1.5ml离心管d在21℃条件下放置1分钟,然后将收集管放入离心机内转速13000转/分钟,离心1分钟,取出DNA纯化柱得到1.5ml离心管中d中的液体,备用;10)将步骤9)中回收、纯化后的液体进行测序,并在Genbank进行比对,确定为玉米青枯病原镰刀菌,即玉米上感染玉米青枯病原镰刀菌;所述的DNA纯化结合液的组成成份:每升DNA纯化结合液中含有25mmol的葡萄糖、10mmol的三羟甲基氨基甲烷‑盐酸、5mmol的乙二胺四乙酸,余量为水;所述的洗涤液的组成成份:按重量百分比洗涤液中含有8%的十二烷基磺酸钠,余量为水;所述的洗脱液的组成成份:每升洗脱液中含50mmol的三羟甲基氨基甲烷、10mmol的乙二胺四乙酸,余量为水;所述的SDS溶液的组成成份:每升SDS溶液中含有50mmol的三羟甲基氨基甲烷和10g的十二烷基硫酸钠,余量为水;所述的氯仿‑异戊醇混合液的组成成分:按体积比氯仿‑异戊醇混合液中含有24份的氯仿和1份的戊醇;所述的TE溶液的组成成份:每升TE溶液中含有10mmol的三羟甲基氨基甲烷‑盐酸、1mmol的乙二胺四乙酸,余量为水。
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