用于基于网络的生物活动评价的系统和方法

摘要

本发明提供了用于量化响应于物剂的生物系统的扰动的系统和方法。处理和控制数据在处理器处接收，并且被用来计算在生物系统中的生物实体的计算因果网络模型的节点的活动测量结果。为模型生成扰动得分，从而表征处理物剂对生物系统的影响。

主权项

一种用于量化响应于物剂的生物系统的扰动的计算机化的方法，包括在第一处理器处接收与生物系统对物剂的响应对应的处理数据集，其中所述生物系统包括或包含多个生物实体，每个生物实体与所述生物实体中的至少另一个相互作用；在第二处理器处接收与未暴露于所述物剂的所述生物系统对应的控制数据集；在第三处理器处提供表示所述生物系统的计算因果网络模型，并且所述计算因果网络模型包括或包含：表示所述生物实体的节点，表示在所述生物实体之间的关系的边，以及所述节点的表示在所述控制数据与所述处理数据之间的预期变化方向的方向值；以第四处理器来计算所述节点的表示在所述处理数据与所述控制数据之间的差异的活动测量结果；以第五处理器来计算所述节点的权重值，其中至少一个权重值不同于至少另一个权重值；以及以第六处理器来为所述计算模型生成表示所述生物系统对于所述物剂的扰动的得分，其中所述得分基于所述方向值、所述权重值和所述活动测量结果。