| 发明名称 | 基于二维统计模型的体细胞拷贝数变异显著性检测方法 | ||
| 摘要 | 一种基于二维统计模型的体细胞拷贝数变异显著性检测方法，其包括，S1采集SCNA数据，并对SCNA数据进行预处理；S2计算SCNA邻近位点间的关系系数，将染色体分割成多个相对独立的SCNA结构单元；S3计算每个SCNA结构单元的统计量，并在全基因组上实施二维随机置换；S4针对SCNA结构单元的不同长度L，通过计算置换样本中任意长度为L的SCNA模式的统计量，在二维空间中构造基于L的零分布D<sub>L</sub>；将相应SCNA的统计量与D<sub>L</sub>进行对比，将所述SCNA的统计量与所述D<sub>L</sub>记为p值；若p值小于设定的阈值，则相应的SCNA显著，具有潜在的癌症功能。 | ||
| 申请公布号 | CN103778350A | 申请公布日期 | 2014.05.07 |
| 申请号 | CN201410010002.9 | 申请日期 | 2014.01.09 |
| 申请人 | 西安电子科技大学 | 发明人 | 袁细国;张军英;杨利英;张胜利 |
| 分类号 | G06F19/18(2011.01)I | 主分类号 | G06F19/18(2011.01)I |
| 代理机构 | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人 | 汤东凤 |
| 主权项 | 一种基于二维统计模型的体细胞拷贝数变异显著性检测方法，其特征在于：其包括，S1采集SCNA数据，并对SCNA数据进行预处理；S2计算SCNA邻近位点间的关系系数，将染色体分割成多个相对独立的SCNA结构单元；S3计算每个SCNA结构单元的统计量，并在全基因组上实施二维随机置换；S4针对SCNA结构单元的不同长度L，通过计算置换样本中任意长度为L的SCNA模式的统计量，在二维空间中构造基于L的零分布D<sub>L</sub>；将相应SCNA的统计量与D<sub>L</sub>进行对比，将所述SCNA的统计量与所述D<sub>L</sub>记为p值；若p值小于设定的阈值，则相应的SCNA显著，具有潜在的癌症功能。 | ||
| 地址 | 710071 陕西省西安市太白南路2号西安电子科技大学 | ||