摘要 |
Настоящее изобретение относится к разработке метода создания ингибитора связывания гликопротеина gp120 ВИЧ с рецептором CD4 или интегрином α4β7 (a4b7). Метод включает молекулярное моделирование соединения, при котором моделируемое соединение виртуально взаимодействует как минимум с двумя аминокислотными остатками из шести мотивов внутри трехмерной структуры gp120 ВИЧ или внутри пептидомиметика, отражающего трехмерную структуру gp120 ВИЧ. При этом такое взаимодействие характеризуется расстоянием между атомами, равным менее 8Å, а упомянутые мотивы включают последовательности DIISLWDQSLKPCVKLT, NVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAE, SGGDPEIVMHSFNCGGEFFYCN, CPKISFEP, FRPGGGDMRDNWRSELYKYKVV и CSS или их варианты. Изобретение также относится к разработке метода поиска ингибитора связывания gp120 ВИЧ с CD4 или интегрином a4b7, соединений, которые замедляют связывание gp120 ВИЧ с CD4 или интегрином a4b7, метода уменьшения теплового движения туннеля внутри gp120 ВИЧ, поиска соединений, используемых для профилактики или лечения ВИЧ-инфекции или связанных с ВИЧ заболеваний, или фармацевтической композиции, включающей любое из упомянутых соединений или ингибиторов. Изобретение также связано с использованием туннеля внутри gp120. |