用于预测能够分泌至体液中的蛋白质的方法及系统

摘要

本发明涉及用于预测蛋白向体液中的分泌的方法及系统。在实施方式中，一种方法利用包含所收集蛋白的分泌性质的特征集来根据该特征集对分类器进行训练，从而识别与可能分泌至生物流体中的蛋白对应的蛋白特征。另一种方法使用已训练的分类器及所接收蛋白序列的鉴定特征，确定所述蛋白序列分泌至生物流体中的概率。在实施方式中，一种系统预测蛋白向生物流体中的分泌。所述系统包括经配置的组件，其用来构建包含所收集蛋白的性质的蛋白特征集、训练分类器来预测可能分泌至生物流体中的蛋白的特征、接收蛋白序列以及将所接收的蛋白序列鉴定为分泌蛋白。

主权项

一种用于预测蛋白向生物流体中的分泌的方法，所述方法包括：接收一种或多种蛋白序列；对所接收的一种或多种蛋白序列的特征进行鉴定；和使用已训练的分类器和所鉴定的特征，确定所述所接收的一种或多种蛋白序列分泌至所述生物流体中的概率，其中所述已训练的分类器对包含已收集的蛋白的性质的蛋白特征集进行访问，并且其中所述性质与存在于已知分泌至所述生物流体中的蛋白集中的蛋白特征对应。