用于检测ALK- 1基因突变的引物组、该引物组的用途及包含该引物组的试剂盒

摘要

本发明公开了用于检测ALK-1基因突变的引物组，至少包括ALK-1基因第1到第10外显子区，3’UTR和启动子中任一区域对应的PCR扩增引物组和PCR测序引物组。本发明还公开了所述引物组的用途、包含所述引物组的试剂盒以及使用所述引物组对ALK-1基因进行PCR扩增方法。所述的引物组可以专一性鉴别ALK-1基因是否突变，确保了测定结果的准确性和唯一性。

主权项

用于检测ALK‑1基因突变的引物组，其特征在于，包括ALK‑1基因的第1到第10外显子区、3’UTR和启动子分别对应的PCR扩增引物组以及PCR测序引物组，其中，所述的PCR扩增引物组为:所述启动子的PCR扩增引物组包括：由引物 PF1和引物PR1组成的引物组、和由引物PF2和引物PR2组成的引物组，引物PF1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，引物PR1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，引物PF2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，引物PR2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述Exon1的PCR扩增引物组包括：由引物PF3和引物PR3组成的引物组，引物PF3的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，引物PR3的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；所述Exon2的PCR扩增引物组包括:由引物PF4和引物PR4组成的引物组，引物PF4的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，引物PR4的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示；所述Exon3的PCR扩增引物组包括：由引物PF5和引物PR5组成的引物组，引物PF5的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示，引物PR5的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示；     所述Exon4的PCR扩增引物组包括:由引物PF6和引物PR6组成的引物组，引物PF6的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示，引物PR6的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示；所述Exon5的PCR扩增引物组包括:由引物PF7和引物PR7组成的引物组，引物PF7的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示，引物PR7的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示；所述Exon6的PCR扩增引物组包括:由引物PF8和引物PR8组成的引物组，引物PF8的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示，引物PR8的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示；所述Exon7的PCR扩增引物组包括:由引物PF9和引物PR9组成的引物组，引物PF9的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示，引物PR9的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示；所述Exon8的PCR扩增引物组包括:由引物PF10和引物PR10组成的引物组，引物PF10的核苷酸序列如SEQ ID NO.19所示，引物PR10的核苷酸序列如SEQ ID NO.20所示；所述Exon9的PCR扩增引物组包括:由引物PF11和引物PR11组成的引物组，引物PF11的核苷酸序列如SEQ ID NO.21所示，引物PR11的核苷酸序列如SEQ ID NO.22所示；所述Exon10的PCR扩增引物组包括:由引物PF12和引物PR12组成的引物组，引物PF12的核苷酸序列如SEQ ID NO.23所示，引物PR12的核苷酸序列如SEQ ID NO.24所示；所述3’UTR的PCR扩增引物组包括：由引物 PF13和引物PR13组成的引物组、由引物 PF14和引物PR14组成的引物组，和由引物PF15和引物PR15组成的引物组，引物PF13的核苷酸序列如SEQ ID NO.25所示，引物PR13的核苷酸序列如SEQ ID NO.26所示，引物PF14的核苷酸序列如SEQ ID NO.27所示，引物PR14的核苷酸序列如SEQ ID NO.28所示，引物PF15的核苷酸序列如SEQ ID NO.29所示，引物PR15的核苷酸序列如SEQ ID NO.30所示；所述的PCR测序引物组为：所述启动子的PCR测序引物组包括：核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的引物 PF1，和核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的引物PF2；所述Exon1的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的引物PF3；所述Exon2的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示的引物PF4；所述Exon3的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示的引物PF5；所述Exon4的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示的引物PF6；所述Exon5的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示的引物PF7；所述Exon6的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示的引物PF8；所述Exon7的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示的引物PF9；所述Exon8的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.19所示的引物PF10；所述Exon9的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.21所示的引物PF11；所述Exon10的PCR测序引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.23所示的引物PF12；所述3’UTR的PCR测序引物组包括：核苷酸序列如SEQ ID NO.25所示的引物PF13，核苷酸序列如SEQ ID NO.27所示的引物PF14，和核苷酸序列如SEQ ID NO.29所示的引物PF15。