发明名称 一种与原发性肺癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用
摘要 本发明属于基因工程及肿瘤医学领域,公开了一种与原发性肺癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用。该标志物为rs107401、rs465498、rs663414、rs622917、rs636586、rs741061、rs855641、rs948783、rs1544694、rs1663689、rs2030378、rs2225588、rs2317683、rs2395166、rs2405271、rs2788713、rs3130975、rs4344933、rs4488809等63个SNP的组合,该标志物可用于制备原发性肺癌辅助诊断试剂盒。
申请公布号 CN102534009B 申请公布日期 2014.03.19
申请号 CN201210013090.9 申请日期 2012.01.16
申请人 南京医科大学 发明人 沈洪兵;胡志斌;马红霞;靳光付;董静;孙重期
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人 徐冬涛;刘成群
主权项 一种检测与原发性肺癌辅助诊断相关的SNP标志物的特异性引物及荧光探针对的组合物,其特征在于,由下列特异性引物及荧光探针对组成,其特异性引物为:rs107401的引物序列为SEQ ID No:1和SEQ ID No:2;rs465498的引物序列为SEQ ID No:5和SEQ ID No:6;rs663414的引物序列为SEQ ID No:9和SEQ ID No:10;rs622917的引物序列为SEQ ID No:13和SEQ ID No:14;rs636586的引物序列为SEQ ID No:17和SEQ ID No:18;rs741061的引物序列为SEQ ID No:21和SEQ ID No:22;rs855641的引物序列为SEQ ID No:25和SEQ ID No:26;rs948783的引物序列为SEQ ID No:29和SEQ ID No:30;rs1544694的引物序列为SEQ ID No:33和SEQ ID No:34;rs1663689的引物序列为SEQ ID No:37和SEQ ID No:38;rs2030378的引物序列为SEQ ID No:41和SEQ ID No:42;rs2225588的引物序列为SEQ ID No:45和SEQ ID No:46;rs2317683的引物序列为SEQ ID No:49和SEQ ID No:50;rs2395166的引物序列为SEQ ID No:53和SEQ ID No:54;rs2405271的引物序列为SEQ ID No:57和SEQ ID No:58;rs2788713的引物序列为SEQ ID No:61和SEQ ID No:62;rs3130975的引物序列为SEQ ID No:65和SEQ ID No:66;rs4344933的引物序列为SEQ ID No:69和SEQ ID No:70;rs4488809的引物序列为SEQ ID No:73和SEQ ID No:74;rs4493136的引物序列为SEQ ID No:77和SEQ ID No:78;rs4669621的引物序列为SEQ ID No:81和SEQ ID No:82;rs4697406的引物序列为SEQ ID No:85和SEQ ID No:86;rs4749794的引物序列为SEQ ID No:89和SEQ ID No:90;rs4809957的引物序列为SEQ ID No:93和SEQ ID No:94;rs6102795的引物序列为SEQ ID No:97和SEQ ID No:98;rs6490820的引物序列为SEQ ID No:101和SEQ ID No:102;rs9317873的引物序列为SEQ ID No:105和SEQ ID No:106;rs9373105的引物序列为SEQ ID No:109和SEQ ID No:110;rs9397087的引物序列为SEQ ID No:113和SEQ ID No:114;rs9463490的引物序列为SEQ ID No:117和SEQ ID No:118;rs10066153的引物序列为SEQ ID No:121和SEQ ID No:122;rs11144475的引物序列为SEQ ID No:125和SEQ ID No:126;rs11155286的引物序列为SEQ ID No:129和SEQ ID No:130;rs11264579的引物序列为SEQ ID No:133和SEQ ID No:134;rs11907465的引物序列为SEQ ID No:137和SEQ ID No:138;rs12050469的引物序列为SEQ ID No:141和SEQ ID No:142;rs12992554的引物序列为SEQ ID No:145和SEQ ID No:146;rs13000907的引物序列为SEQ ID No:149和SEQ ID No:150;rs16883398的引物序列为SEQ ID No:153和SEQ ID No:154;rs16959825的引物序列为SEQ ID No:157和SEQ ID No:158;rs17058190的引物序列为SEQ ID No:161和SEQ ID No:162;rs17075390的引物序列为SEQ ID No:165和SEQ ID No:166;rs17728461的引物序列为SEQ ID No:169和SEQ ID No:170;rs1014588的引物序列为SEQ ID No:173和SEQ ID No:174;rs1039119的引物序列为SEQ ID No:177和SEQ ID No:178;rs1726744的引物序列为SEQ ID No:181和SEQ ID No:182;rs2285947的引物序列为SEQ ID No:185和SEQ ID No:186;rs2895680的引物序列为SEQ ID No:189和SEQ ID No:190;rs3969178的引物序列为SEQ ID No:193和SEQ ID No:194;rs4693311的引物序列为SEQ ID No:197和SEQ ID No:198;rs4766994的引物序列为SEQ ID No:201和SEQ ID No:202;rs4894545的引物序列为SEQ ID No:205和SEQ ID No:206;rs4940849的引物序列为SEQ ID No:209和SEQ ID No:210;rs6490294的引物序列为SEQ ID No:213和SEQ ID No:214;rs6780858的引物序列为SEQ ID No:217和SEQ ID No:218;rs9439527的引物序列为SEQ ID No:221和SEQ ID No:222;rs9556016的引物序列为SEQ ID No:225和SEQ ID No:226;rs12002185的引物序列为SEQ ID No:229和SEQ ID No:230;rs12793370的引物序列为SEQ ID No:233和SEQ ID No:234;rs1549058的引物序列为SEQ ID No:237和SEQ ID No:238;rs2736100的引物序列为SEQ ID No:241和SEQ ID No:242;rs6043705的引物序列为SEQ ID No:245和SEQ ID No:246;rs11699642的引物序列为SEQ ID No:249和SEQ ID No:250;其荧光探针对为:rs107401的荧光探针对序列为SEQ ID No:3和SEQ ID No:4;rs465498的荧光探针对序列为SEQ ID No:7和SEQ ID No:8;rs663414的荧光探针对序列为SEQ ID No:11和SEQ ID No:12;rs622917的荧光探针对序列为SEQ ID No:15和SEQ ID No:16;rs636586的荧光探针对序列为SEQ ID No:19和SEQ ID No:20;rs741061的荧光探针对序列为SEQ ID No:23和SEQ ID No:24;rs855641的荧光探针对序列为SEQ ID No:27和SEQ ID No:28;rs948783的荧光探针对序列为SEQ ID No:31和SEQ ID No:32;rs1544694的荧光探针对序列为SEQ ID No:35和SEQ ID No:36;rs1663689的荧光探针对序列为SEQ ID No:39和SEQ ID No:40;rs2030378的荧光探针对序列为SEQ ID No:43和SEQ ID No:44;rs2225588的荧光探针对序列为SEQ ID No:47和SEQ ID No:48;rs2317683的荧光探针对序列为SEQ ID No:51和SEQ ID No:52;rs2395166的荧光探针对序列为SEQ ID No:55和SEQ ID No:56;rs2405271的荧光探针对序列为SEQ ID No:59和SEQ ID No:60;rs2788713的荧光探针对序列为SEQ ID No:63和SEQ ID No:64;rs3130975的荧光探针对序列为SEQ ID No:67和SEQ ID No:68;rs4344933的荧光探针对序列为SEQ ID No:71和SEQ ID No:72;rs4488809的荧光探针对序列为SEQ ID No:75和SEQ ID No:76;rs4493136的荧光探针对序列为SEQ ID No:79和SEQ ID No:80;rs4669621的荧光探针对序列为SEQ ID No:83和SEQ ID No:84;rs4697406的荧光探针对序列为SEQ ID No:87和SEQ ID No:88;rs4749794的荧光探针对序列为SEQ ID No:91和SEQ ID No:92;rs4809957的荧光探针对序列为SEQ ID No:95和SEQ ID No:96;rs6102795的荧光探针对序列为SEQ ID No:99和SEQ ID No:100;rs6490820的荧光探针对序列为SEQ ID No:103和SEQ ID No:104;rs9317873的荧光探针对序列为SEQ ID No:107和SEQ ID No:108;rs9373105的荧光探针对序列为SEQ ID No:111和SEQ ID No:112;rs9397087的荧光探针对序列为SEQ ID No:115和SEQ ID No:116;rs9463490的荧光探针对序列为SEQ ID No:119和SEQ ID No:120;rs10066153的荧光探针对序列为SEQ ID No:123和SEQ ID No:124;rs11144475的荧光探针对序列为SEQ ID No:127和SEQ ID No:128;rs11155286的荧光探针对序列为SEQ ID No:131和SEQ ID No:132;rs11264579的荧光探针对序列为SEQ ID No:135和SEQ ID No:136;rs11907465的荧光探针对序列为SEQ ID No:139和SEQ ID No:140;rs12050469的荧光探针对序列为SEQ ID No:143和SEQ ID No:144;rs12992554的荧光探针对序列为SEQ ID No:147和SEQ ID No:148;rs13000907的荧光探针对序列为SEQ ID No:151和SEQ ID No:152;rs16883398的荧光探针对序列为SEQ ID No:155和SEQ ID No:156;rs16959825的荧光探针对序列为SEQ ID No:159和SEQ ID No:160;rs17058190的荧光探针对序列为SEQ ID No:163和SEQ ID No:164;rs17075390的荧光探针对序列为SEQ ID No:167和SEQ ID No:168;rs17728461的荧光探针对序列为SEQ ID No:171和SEQ ID No:172;rs1014588的荧光探针对序列为SEQ ID No:175和SEQ ID No:176;rs1039119的荧光探针对序列为SEQ ID No:179和SEQ ID No:180;rs1726744的荧光探针对序列为SEQ ID No:183和SEQ ID No:184;rs2285947的荧光探针对序列为SEQ ID No:187和SEQ ID No:188;rs2895680的荧光探针对序列为SEQ ID No:191和SEQ ID No:192;rs3969178的荧光探针对序列为SEQ ID No:195和SEQ ID No:196;rs4693311的荧光探针对序列为SEQ ID No:199和SEQ ID No:200;rs47669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