稻瘟病抗性基因Pi63的功能特异性分子标记及其方法与应用

摘要

本发明公开了稻瘟病抗性基因Pi63的2对功能性分子标记YRT3和YRT4及其方法与应用，通过比对和分析多个水稻品种中Pi63等位基因及其编码区上游序列，得到有别于感病等位基因以及其他稻瘟病抗性基因的Pi63功能特异性位点2处；通过设计引物，分别得到SEQIDNO.1和SEQIDNO.2，以及SEQIDNO.3和SEQIDNO.4；利用该引物扩增水稻总DNA，分别得到Pi63功能特异性分子标记YRT3和YRT4。本发明可在大量的水稻种质资源中筛选、鉴定该功能性抗性基因，以及在分子标记辅助选择育种、基因聚合育种以及转基因育种中的得到应用。

主权项

稻瘟病抗性基因Pi63的功能特异性分子标记YRT3或YRT4，其特征在于：分子标记YRT3是通过正向引物如SEQ ID NO. 1所示序列和反向引物如SEQ ID NO. 2所示序列从水稻总DNA中扩增出来的核苷酸序列，并经特异性酶切后再电泳检测到的与稻瘟病抗性基因Pi63呈特异性带型的分子标记；分子标记YRT4是通过正向引物如SEQ ID NO. 3所示序列和反向引物如SEQ ID NO. 4所示序列从水稻总DNA中扩增出来的核苷酸序列，经直接电泳检测到的与稻瘟病抗性基因Pi63呈特异性带型的分子标记；其中，所述的水稻为水稻品种为羊毛谷（YMG）。