一种菠萝成熟衰老相关基因的分子标记方法

摘要

本发明提供一种菠萝成熟衰老相关基因的分子标记方法：提取采后菠萝衰老过程各阶段的RNA；对菠萝成熟衰老过程中的转录组进行了测序，组装得到了81129个unique基因；在此基础上使用SSR软件MicroSAtellite(MISA)进行了SSR扫描，找到了35099个SSR分子标记，供菠萝多态性分析；对所有SSR重复单元在Unigene上前后序列的长度进行筛选。只保留前后序列均不小于150bp的SSR，用其设计引物；不同物种间，进行PCR扩增并通过PAGE技术进行多态性检测。通过本发明，获得了菠萝衰老相关的基因表达谱，然后对获得的序列进行SSR标记扫描，确认其多态性。

主权项

一种菠萝成熟衰老相关基因的分子标记方法，其特征在于，它包括如下步骤：(1)提取采后菠萝衰老过程各阶段的RNA；(2)通过Illumina Solexa Hiseq2000对菠萝成熟衰老过程中的转录组进行了测序，组装得到了81129个unique基因；(3)在此基础上使用SSR软件MicroSAtellite(MISA)进行了SSR扫描，找到了35099个SSR分子标记，供菠萝多态性分析；(4)对所有SSR重复单元在Unigene上前后序列的长度进行筛选。只保留前后序列均不小于150bp的SSR，用其设计引物；(5)不同物种间，进行PCR扩增并通过PAGE技术进行多态性检测。