Procedimiento para la detección e identificación rápida de bioagentes

摘要

Un procedimiento para identificar un bioagente desconocido que comprende: a) alinear una pluralidad de secuencias de genes de ácidos nucleicos de organismos de identidad conocida; b) analizar dicha pluralidad de secuencias para regiones de conservación y variación; c) identificar una pluralidad de regiones variables que flanquean sitios que enlazan con cebadores para cebar y obtener una o más regiones amplificables dentro de dicha pluralidad de secuencias; d) identificar las composiciones base de dichas una o más regiones amplificables para miembros de dicha pluralidad de organismos conocidos para obtener una pluralidad de composiciones base de regiones amplificables indexadas a la identidad de uno o más miembros de dicha pluralidad de organismos de identidad conocida; e) preparar una base de datos que contiene dichas composiciones base e identidades indexadas de miembros de dicha pluralidad de organismos obtenidos en el paso d). f) determinar una composición base de un ácido nucleico del mencionado bioagente desconocido, poniendo en contacto el ácido nucleico con al menos un par de cebadores de oligonucleótidos que hibridizan a secuencias de las mencionadas una o más regiones amplificables, amplificando la secuencia de ácidos nucleicos variable para producir un producto de la amplificación, determinar la masa molecular de dicho producto de la amplificación por espectrometría de masas y determinar después la composición base del producto de la amplificación; y g) identificar el mencionado bioagente desconocido comparando la mencionada composición base del mencionado ácido nucleico del mencionado bioagente desconocido con la mencionada base de datos.