发明名称 |
荞麦AFLP反应体系的建立方法及其应用 |
摘要 |
本发明提供了一种荞麦的AFLP反应体系的建立方法。上述荞麦AFLP反应体系的建立方法,通过改进AFLP关键步骤的反应条件,适当地增加了抽提的次数,既将反应液中的杂质去除干净,又减少荞麦DNA机械断裂,提高DNA提取的质量;设置的酶切时间可充分地将荞麦基因组DNA进行酶切;设置的Mg2+浓度既可提高产物特异性DNA的产出率,又避免了非特异性DNA扩增,建立了可靠性好、重复性强、可信度高、方便快速的适用于荞麦的反应体系,只需极少量的DNA样品,不需要Southern杂交,不需要预先知道DNA的序列信息。该方法工艺简单、易于操作,并且产出量高、降低了生产成本。 |
申请公布号 |
CN103484449A |
申请公布日期 |
2014.01.01 |
申请号 |
CN201310422761.1 |
申请日期 |
2013.09.16 |
申请人 |
深圳市圣西马生物技术有限公司 |
发明人 |
潘韵;侯雅君;李永新;郑文官;陈义昆;唐明辉 |
分类号 |
C12N15/10(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12N15/10(2006.01)I |
代理机构 |
深圳中一专利商标事务所 44237 |
代理人 |
张全文 |
主权项 |
一种荞麦的AFLP反应体系的建立方法,包括如下步骤:将荞麦叶片加入CTAB提取液反应0.5~2小时,抽提,得到模板DNA;将所述模板DNA与内切酶体系混合,在35~38℃下反应1~9小时,得到酶切后的DNA;其中,所述模板DNA与所述内切酶体系的容量比为1~2:9~8,所述模板DNA的OD260‑280值为1.8~2.0;将所述酶切后的DNA与连接体系混合,在16~22℃下反应3~10小时,得到连接后的DNA;其中,所述酶切后的DNA与所述连接体系的容量比为1~2:4~5;将所述连接后的DNA与预扩增体系混合,进行第一次PCR反应,得到预扩增的DNA;其中,所述连接后的DNA与所述预扩增体系的容量比为3~5:15~17;将所述预扩增后的DNA与选择性扩增体系混合,进行第二次PCR反应,得到扩增后的特异性DNA;其中,所述预扩增后的DNA与选择性扩增体系的容量比为3~5:15~17;其中,所述选择性扩增体系包含浓度为0.2~1.0mmol/L的第一选择性引物和浓度为0.2~1.0mmol/L的第二选择性引物、浓度为0~3.0mmol/L的含Mg2+盐溶液;其中,所述第一选择性引物、第二选择性引物与含Mg2+盐溶液的容量比为4~6:4~6:5~15。 |
地址 |
518000 广东省深圳市南山区高新中四道31号研祥科技大厦10楼B1-B2单元 |