稻瘟病抗性基因Pia-C功能特异性分子标记及其方法与应用

摘要

本发明公开了一种稻瘟病抗性基因Pia-C功能特异性分子标记及其方法与应用。该分子标记由Pia-C-1FNP和Pia-C-2FNP组成。本发明通过对多个水稻稻瘟病抗性基因Pia-C的等位基因序列与SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6序列做比对的方法，分析得到能区别于其他感病等位基因以及其他稻瘟病抗性基因功能特异性的一对单碱基差异。再通过设计，分别得到SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2，以及SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4引物，对水稻DNA扩增，分别得到Pia-C功能特异性分子标记Pia-C-1FNP和Pia-C-2FNP，二者组合则可准确地检测功能性的Pia-C。本发明可在大量的水稻种质资源中筛选、鉴定该功能性抗性基因，以及在分子标记辅助选择育种、基因聚合育种以及转基因育种中的得到应用。

主权项

一种稻瘟病抗性基因Pia‑C功能特异性分子标记Pia‑C‑FNP，其特征在于：它由Pia‑C‑1FNP和Pia‑C‑2FNP组合而成；分别通过引物对SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2，以及SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 4从水稻总DNA中扩增出来的核苷酸序列，并经特异性酶切之后，与稻瘟病抗性基因 Pia‑C呈特异性带型的分子标记； 所述引物对SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2，以及SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 4的核苷酸序列如下所示： SEQ ID NO. 1：5’‑ TGCAAGCTAATGGCTGGTCGA‑3’；SEQ ID NO. 2： 5’‑TAGACTGGTGTAGTTGCGGAC‑3’；SEQ ID NO. 3： 5’‑GTGCAGTCCTGATCAGTACTC‑3’；SEQ ID NO. 4： 5’‑AGAGCCACCAGGCGAACAG‑3’；所述的水稻为水稻品种CO39；所述的特异性酶切为通过SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2扩增得到的PCR产物使用Sa lI酶切；通过SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 4扩增得到的PCR产物使用PvuⅡ酶切。