利用核苷酸化学分子式鉴定植物品种的方法

摘要

本发明公开了一种利用核苷酸化学分子式鉴定植物品种的方法。包括如下步骤：1）利用叶绿体基因组DNA序列设计引物，用引物对植物品种的基因组DNA进行PCR扩增，得到PCR产物；2）PCR直接测序获得品种的目的DNA区域的核苷酸序列，通过品种间的核苷酸序列比对，找到多态位点及其位置，列出各品种对应的核苷酸分子式；3）将核苷酸分子式应用于植物品种分类鉴定和管理。本发明的实验证明，本方法以核苷酸分子式的形式鉴定植物品种的谱系，是一种较为精确、简捷的方法，弥补了以往分析方法的不足。

主权项

一种鉴定或辅助鉴定待测牡丹品种的方法，包括如下步骤：1）用引物对对待测牡丹品种进行PCR扩增，获得目的区域的PCR产物；所述引物对由序列表中序列1和序列表中序列2所示的DNA分子组成；2）将所述PCR产物测序，得到待测牡丹品种目的区域的核苷酸序列；3）将所述待测牡丹品种目的区域的核苷酸序列与核苷酸序列组群进行比对，找出单核苷酸多态性位点，列出待测牡丹品种核苷酸分子式；所述待测牡丹品种的核苷酸分子式的通式为：Bx1Bx2Bx3…Bxn，其中，B为单核苷酸多态性位点上的碱基种类，为A、T、C和G四种碱基中的任意一种；x1为第1个单核苷酸多态性位点在所述待测牡丹品种目的区域的核苷酸序列中从5’末端起的位置顺序编号，x2为第2个单核苷酸多态性位点在所述待测牡丹品种目的区域的核苷酸序列中从5’末端起的位置顺序编号，类推，xn为第n个单核苷酸多态性位点在所述待测牡丹品种目的区域的核苷酸序列中从5’末端起的位置顺序编号；所述Bx1Bx2Bx3…Bxn为所有单核苷酸多态性位点按照其在所述待测牡丹品种目的区域的核苷酸序列中从5’末端起依次列出；所述核苷酸序列组群由序列表中序列3、序列4、序列5和序列6组成；4）将所述待测牡丹品种核苷酸分子式与核苷酸分子式组群比对，确定待测牡丹品种；所述核苷酸分子式组群由如下四种核苷酸分子式组成：T3C301A348G416C571G712、G3C301G348G416A571G712、T3A301G348G416A571T712和T3A301G348A416A571T712；每一种所述核苷酸分子式对应一个牡丹品种组群。