发明名称 一种TTR小分子抑制剂的筛选方法
摘要 本发明的目的是建立一种高效、快速、可靠的TTR小分子抑制剂筛选方法,以弥补现有技术的不足,适用于TTR纤维化所引发的淀粉样变性疾病的药物设计。使用了3D-QSAR、分子对接、药效团模型等多种方法对小分子数据库进行筛选和预测,初步确定可作为先导化合物的小分子,进行进一步的细胞筛选。本发明的筛选方法快速高效,使用包括基于受体和基于配体的多种药物筛选及设计方法,大大提高了筛选结果的可靠性。利用筛选得到的先导化合物进行细胞水平的生物筛选,提高了筛选速度,缩短了新型抑制剂的开发研究周期。
申请公布号 CN103425859A 申请公布日期 2013.12.04
申请号 CN201210163338.X 申请日期 2012.05.24
申请人 北京化工大学 发明人 雷鸣;袁天虎
分类号 G06F19/00(2011.01)I 主分类号 G06F19/00(2011.01)I
代理机构 代理人
主权项 一种TTR小分子抑制剂的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)确定TTR蛋白质分子的PDB数据;(2)优化抑制剂分子,建立3D‑QSAR模型并验证其可靠性;(3)使用分子对接软件将小分子抑制剂与TTR蛋白质进行对接并与晶体结构进行比对,验证对接其可靠性;(4)建立药效团模型,对药物小分子数据库进行筛选;(5)使用3D‑QSAR模型重新打分并对打分高的小分子使用分子对接方法再次筛选;(6)根据筛选的结果,初步确定可作为先导化合物的小分子。
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