克隆高粱花叶病毒甘蔗分离物全基因组的引物组及方法

摘要

本发明涉及一种克隆高粱花叶病毒甘蔗分离物全基因组的引物组及方法，克隆高粱花叶病毒甘蔗分离物全基因组的引物组包括7对引物，依次具有如序列表中SEQIDNO.1~SEQIDNO.14所示的核苷酸序列；以感染SrMV的甘蔗叶片总RNA为模板进行反转录反应，再以反转录产物作为模板，分别利用上述引物进行PCR扩增，对所有片段进行测序和拼接，即获得SrMV基因组全长序列。本发明的引物扩增片段相互重叠，覆盖了SrMV基因组近全长序列，能够克隆SrMV不同株系的全基因序列；本发明利用分段克隆SrMV全基因组的方法，具有简便、有效、快速的优点，为克隆SrMV全基因组序列提供了便捷有效的新途径。

主权项

一种克隆高粱花叶病毒甘蔗分离物全基因组的引物组，其特征在于引物或简并引物序列如下：SrMV‑5F1：5'‑AAAACAACAAGACTCAACACAACA‑3'SrMV‑5R1：5'‑GGCTGCRAARTGTTCCAT‑3'SrMV‑F1：5'‑TCACGGTTCAAGMGCAAGG‑3'SrMV‑R1：5'‑GAATGTAATGGCAAATCKGC‑3'SRMV‑F2：5'‑CAAGCCATGTCATATTGGATAG‑3'SRMV‑R2：5'‑GGTGCTTCCATTATRTGACA‑3'SRMV‑F3：5'‑GCAGCAACAGTTAGCATAGG‑3'SRMV‑R3：5'‑TGCGYGGTAACGAGTAAGG‑3'SrMV‑F4：5'‑GATAGCMACAGAAGCAGCCT‑3'SrMV‑R4：5'‑ATTCCWACRGTCCAAGGTC‑3'SrMV‑F5：5'‑TGAATGCMGCAGTWGGAG‑3'SrMV‑R5：5'‑CGCTGAAGTCCGTATCTTG‑3'SrMV‑F6：5'‑TTGGACMATGATGGATGGAG‑3'SrMV‑R6：5'‑CTCTTGCYACAAKACTCGCAGC‑3'。