一种通用的靶向蛋白嵌合型分子化合物的构建方法

摘要

本发明公开了一种通用的靶向蛋白嵌合型分子化合物的构建方法，目的在于通过靶向泛素化途径降解蛋白质来提供一种调节蛋白质水平的方法，主要包括如下步骤：1）查找和分析靶蛋白的三维结构，并预测活性位点；2）选择化合物数据库；3）计算机虚拟筛选与靶蛋白适配程度高的配体化合物；4）获取筛选出的配体化合物，并利用小分子与蛋白间相互作用的检测方法筛选出最优靶蛋白配体化合物；5）根据计算机模拟结合方式构建由最优靶蛋白配体化合物、泛素连接酶E3识别配体及连接两者的Linker组成的靶向蛋白嵌合型分子化合物；6）化学合成靶向蛋白嵌合型分子化合物。使用本方法可快速高效地制备靶向蛋白嵌合型分子化合物，实现特异性降解细胞内的靶蛋白。

主权项

一种靶向蛋白嵌合型分子化合物的构建方法，其特征在于包括如下步骤：①查找和分析靶蛋白的三维结构并预测其活性位点；②选择化合物数据库，根据研究目的对数据库进行初步筛选；③采用基于分子对接的计算机虚拟筛选方法获得一组候选的与靶蛋白适配程度高的配体化合物；④进一步对候选的配体化合物进行人工筛选，从中选择出一组最适靶蛋白配体化合物；⑤获取步骤④所筛选出的最适靶蛋白配体化合物；⑥利用小分子与蛋白间相互作用检测方法进一步从所述最适靶蛋白配体化合物中筛选出与靶蛋白活性位点具有最佳结合力的最优靶蛋白配体化合物；⑦参考计算机模拟的最优靶蛋白配体化合物与靶蛋白结合方式，构建由所述最优靶蛋白配体化合物、泛素连接酶E3识别配体及连接两者的Linker组成的靶向蛋白嵌合型分子化合物；⑧用化学法合成步骤⑦所构建的靶向蛋白嵌合型分子化合物。