发明名称 一种高通量全基因组DNA甲基化检测技术
摘要 本发明的目的在于提供一种高通量全基因组DNA甲基化检测方法,用甲基化修饰依赖性限制性酶FspEI对基因组DNA进行酶切,基因组中CG 或 CHG 位点上的甲基化修饰均可以被 FspEI 识别,酶切后产生具有核心甲基化位点的等长标签,对标签文库进行高通量测序技术能够获得全基因组范围内的甲基化位点序列信息。本方法可以实现甲基化修饰位点的准确定位,通过酶切富集基因组甲基化位点,直接对甲基化标签序列进行测序和定量,可以有效降低测序费用。实验流程仅需两天,具有通量高、操作简便、成本低廉、可靠性好等优点,是一种优良的适用于非模式生物的高通量全基因组甲基化检测方法。
申请公布号 CN103233072A 申请公布日期 2013.08.07
申请号 CN201310163085.0 申请日期 2013.05.06
申请人 中国海洋大学 发明人 王师;吕佳;包振民;张玲玲;胡晓丽;陆维
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 代理人 曾庆国
主权项 一种全基因组DNA甲基化检测方法,包括如下的步骤:1)将基因组DNA用内切酶FspEI酶进行酶切,获得酶切片段;2)将酶切片段的两端分别连接上接头,作为扩增引物的结合点;3)将连接上接头的酶切片段用引物进行第一轮PCR扩增,从而富集接头连接正确的酶切片段;4)将第一轮PCR扩增产物经凝胶纯化后用引物进行第二轮PCR扩增,引入Barcode来构建测序文库;5)测序文库进行测序;将测序数据进行分析得到全基因组甲基化信息。
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