发明名称 斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用
摘要 本发明涉及一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用,包括:(1)斧文蛤基因组DNA的提取(2)根据cDNA数据库中斧文蛤的EST序列,获得含有SSR重复的基因序列;(3)SSR标记引物设计;(4)斧文蛤不同地理居群DNA的PCR扩增及扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测;(5)获得斧文蛤EST序列区呈现高度遗传变异的多态图谱,对图谱分析可得到斧文蛤每个个体EST-SSR的基因型。本发明的检测方法具有快速、方便、准确等优点,能够直观的检测出斧文蛤不同个体的基因型。本发明可应用于斧文蛤群体遗传变异分析、种质资源保护与管理、系谱认证及遗传连锁图谱构建等领域。
申请公布号 CN103146813A 申请公布日期 2013.06.12
申请号 CN201310035598.3 申请日期 2013.01.30
申请人 浙江省海洋水产养殖研究所 发明人 刘博;柴雪良;张炯明;滕爽爽;邵艳卿;方军;肖国强;闫茂仓;庞少华
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 温州瓯越专利代理有限公司 33211 代理人 陈加利
主权项 一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物,其特征在于包括有:FW‑134:F:ACTACTAGGAACTTGCAT;R:GACAGTTTGGTTAAGAAT;退火温度为45℃,核心重复序列为(ATG)8;FW‑390:F: GCCATAGTAGTCAGAGGG ;R: AGAGATTATAGTGAACAAAGC;退火温度为48℃,核心重复序列为(CATT)6;FW‑496:F:TTGATCTAGGCAGTCGTT;R:GGCACTTCGTGTAAACAT;退火温度为46℃,核心重复序列为(TG)17;FW‑599:F:CTCAATGAATCGGACTGG;R:ATGAAAACTGGATGTCGC;退火温度为46℃,核心重复序列为(AATTG)5FW‑808:F:TTTTACCTTTCCCGAATA;R:GATGTTACGATGCCACTT;退火温度为45℃,核心重复序列为(AT)6FW‑832:F: CTGCCACAGAATCATAGA;R: CTTCAAATCAGCAACTCA;退火温度为45℃,核心重复序列为(AT)8 。
地址 325000 浙江省温州市河通桥6-1号