发明名称 |
斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用 |
摘要 |
本发明涉及一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用,包括:(1)斧文蛤基因组DNA的提取(2)根据cDNA数据库中斧文蛤的EST序列,获得含有SSR重复的基因序列;(3)SSR标记引物设计;(4)斧文蛤不同地理居群DNA的PCR扩增及扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测;(5)获得斧文蛤EST序列区呈现高度遗传变异的多态图谱,对图谱分析可得到斧文蛤每个个体EST-SSR的基因型。本发明的检测方法具有快速、方便、准确等优点,能够直观的检测出斧文蛤不同个体的基因型。本发明可应用于斧文蛤群体遗传变异分析、种质资源保护与管理、系谱认证及遗传连锁图谱构建等领域。 |
申请公布号 |
CN103146813A |
申请公布日期 |
2013.06.12 |
申请号 |
CN201310035598.3 |
申请日期 |
2013.01.30 |
申请人 |
浙江省海洋水产养殖研究所 |
发明人 |
刘博;柴雪良;张炯明;滕爽爽;邵艳卿;方军;肖国强;闫茂仓;庞少华 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
温州瓯越专利代理有限公司 33211 |
代理人 |
陈加利 |
主权项 |
一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物,其特征在于包括有:FW‑134:F:ACTACTAGGAACTTGCAT;R:GACAGTTTGGTTAAGAAT;退火温度为45℃,核心重复序列为(ATG)8;FW‑390:F: GCCATAGTAGTCAGAGGG ;R: AGAGATTATAGTGAACAAAGC;退火温度为48℃,核心重复序列为(CATT)6;FW‑496:F:TTGATCTAGGCAGTCGTT;R:GGCACTTCGTGTAAACAT;退火温度为46℃,核心重复序列为(TG)17;FW‑599:F:CTCAATGAATCGGACTGG;R:ATGAAAACTGGATGTCGC;退火温度为46℃,核心重复序列为(AATTG)5FW‑808:F:TTTTACCTTTCCCGAATA;R:GATGTTACGATGCCACTT;退火温度为45℃,核心重复序列为(AT)6FW‑832:F: CTGCCACAGAATCATAGA;R: CTTCAAATCAGCAACTCA;退火温度为45℃,核心重复序列为(AT)8 。 |
地址 |
325000 浙江省温州市河通桥6-1号 |