发明名称 |
四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法 |
摘要 |
本发明涉及一种四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,包括如下步骤:(1)挑选差异表达基因,(2)作用靶点预测分析,(3)通路富集分析,(4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤抗辐射作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点,即得四物汤抗辐射作用靶点。本发明提供了一种快速、精确的四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,通过本发明可成功筛选出四物汤发挥抗辐射作用的靶点(靶向蛋白),有助于从分子层面解释其抗辐射作用机理,为抗辐射天然药物的开发以及其他中药确切作用靶点的筛选提供了新思路。 |
申请公布号 |
CN103150488A |
申请公布日期 |
2013.06.12 |
申请号 |
CN201210454959.3 |
申请日期 |
2012.11.14 |
申请人 |
无锡力盟生物科技有限公司 |
发明人 |
石铁流;方钊 |
分类号 |
G06F19/16(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/16(2011.01)I |
代理机构 |
无锡华源专利事务所(普通合伙) 32228 |
代理人 |
冯智文 |
主权项 |
一种四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,其特征在于包括如下步骤: (1)挑选差异表达基因:从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据,得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF‑7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF‑7的表达谱数据,以前者作为试验组,后者作为对照组,挑选出二者差异表达基因; (2)作用靶点预测分析: 利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点,并将其与步骤(1)所得差异表达基因进行交集,得到四物汤预测作用靶点; (3)通路富集分析: 对步骤(2)所得预测作用靶点进行通路富集分析,得到富集通路; (4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤抗辐射作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点,即得四物汤抗辐射作用靶点。 |
地址 |
214000 江苏省无锡市锡山区锡山经济开发区芙蓉中三路99号 |