用于发现中药活性成分及其作用靶点的网络药理学方法

摘要

本发明公开了一种用于发现中药活性成分及其作用靶点的网络药理学方法，包括：收集可用于构建训练集的化合物和蛋白质，并根据化合物的分子结构和蛋白质的氨基酸序列分别计算特征描述符；基于化合物和蛋白质的特征描述符构建训练集，并使用机器学方法建立化合物和蛋白质相互作用的预测模型；对需要预测的中药，收集其已知的化合物成分，计算特征描述符并构建预测集；使用建立的模型对预测集进行预测，并把预测获得的相互作用结果高于给定阈值的化合物和蛋白质用于构建网络；网络节点的连接数较大的化合物和蛋白质即为潜在活性成分和作用靶点。本发明可以提高中药活性成分和作用靶点发现的准确率和效率。

主权项

一种用于发现中药活性成分及其作用靶点的网络药理学方法，其特征在于，包括：（A）收集用于构建训练集的化合物、蛋白质和它们之间的相互作用数据；（B）分别获取所述化合物的分子结构和所述蛋白质的氨基酸序列；（C）根据所述化合物的分子结构计算化合物的分子描述符，根据所述蛋白质的氨基酸序列计算蛋白质的特征描述符；（D）根据所述分子描述符和特征描述符以及两者之间的相互作用数据构建训练集；（E）基于所构建的训练集，使用机器学习方法建立化合物和蛋白质相互作用预测模型；（F）对需要预测的中药，收集其已知的化合物成分，计算所述化合物成分的分子描述符，连同步骤（C）中得到的蛋白质的特征描述符构建预测集；（G）使用所述预测模型对所述预测集进行预测；（H）根据步骤（G）得到的模型预测结果构建化合物和蛋白质相互作用网络；（I）通过对所述网络分析，得到需要预测的中药的潜在活性成分和相应靶点。