| 摘要 |
1. Способ детектирования и характеризации токсиногенного штамма Clostridium difficile в пробе, в котором выполняют следующие стадии:а. предоставляют пробу;b. в мультиплексном ПЦР-анализеi) эту пробу анализируют в отношении присутствия или отсутствия гена tcdB цитотоксина;ii) эту пробу анализируют в отношении присутствия или отсутствия одной или нескольких из следующих делеций в гене tcdC,a) делеций 18 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 330 до нуклеотида 347;b) делеций 36 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 301 до нуклеотида 336;c) делеций 39 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 341 до нуклеотида 370;d) делеций 54 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 313 до нуклеотида 366;e) делеций единственного нуклеотида в положении 117 SEQ ID NO: 1,где мультиплексная ПЦР-амплификация является количественной ПЦР реального времени.2. Способ по п.1, где пробу дополнительно анализируют в отношении присутствия или отсутствия делеций 1,8 т.п.н. гена tcdA энтеротоксина.3. Способ по п.1 или 2, где пробу дополнительно анализируют в отношении присутствия или отсутствия cdtA и/или cdtB бинарного токсина.4. Способ по п.1 или 2, где эту пробу анализируют наа. присутствие или отсутствие всех из следующих делеций:b. делеции 18 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 330 до нуклеотида 347, делеции 39 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 341 до нуклеотида 370,с. делеции единственного нуклеотида в положении 117 SEQ ID NO: 1,d. присутствие или отсутствие гена tcdB цитотоксина,е. присутствие или отсутствие делеции 1,8 т.п.н. tcdA иf. присутствие или отсутствие гена cdtA/B бинарного токсина.5. Способ по п.3, где эту пробу анализируют наа. присутствие или отсутствие всех из следующих делеции:b. делеции 18 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 330 до нуклеотида 347, делеции 39 п.н. в SEQ ID NO: 1 от нуклеотида 341 до нуклео� |
