发明名称 一种基因组序列的指纹特征曲线的构造方法
摘要 本发明属于生物信息学技术领域,更确切的是涉及一种基因组序列的指纹特征曲线的构造方法。该构造方法包括三个步骤:建立基因组序列中的每个碱基所对应的三维空间坐标值;利用每个碱基的三维空间坐标值绘制基因组序列的三维空间曲线;利用每个碱基的三维空间坐标值进行不同组合后绘制基因组序列的二维平面轨迹曲线。本发明的优点是:对于给定的基因组序列,可构造可重复的、唯一的、有效的指纹特征曲线。本发明在基因组序列的个性化指纹特征识别与分析方面有应用前景。
申请公布号 CN103106353A 申请公布日期 2013.05.15
申请号 CN201310049589.X 申请日期 2013.02.07
申请人 艾云灿;孟繁梅;赵磊;艾汉南 发明人 艾云灿;孟繁梅;赵磊;艾汉南
分类号 G06F19/26(2011.01)I;G06F19/22(2011.01)I 主分类号 G06F19/26(2011.01)I
代理机构 代理人
主权项 一种基因组序列的指纹特征曲线的构造方法,其特征在于:包括以下三个步骤:步骤1:建立基因组序列中的每个碱基所对应的三维空间坐标值,采用本发明公布的一组公式,分别计算基因组序列中的每个碱基所对应的三维空间坐标值(xn, yn, zn)(其中,n=1, 2, …, N;N为基因组序列的长度);步骤2:利用每个碱基的三维空间坐标值绘制基因组序列的三维空间曲线,利用由步骤1建立的三维空间坐标值(xn, yn, zn),采用绘图软件绘制三维空间曲线(xn~yn~zn)(其中,n=1, 2, …, N;N为基因组序列的长度);步骤3:利用每个碱基的三维空间坐标值进行不同组合后绘制基因组序列的二维平面轨迹曲线,利用由步骤1建立的三维空间坐标值,进行六种不同组合(xn~n),(yn~n),(zn~n),(yn~xn),(zn~yn),(zn~xn)(其中,n=1, 2, …, N;N为基因组序列的长度)分别选择相应的纵坐标与横坐标,从而构成6种类型的二维平面,采用绘图软件绘制一组二维平面曲线。
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