发明名称 |
肠道病毒71型2A蛋白酶的晶体结构及其在药物设计中的应用 |
摘要 |
肠道病毒71型2A蛋白酶的晶体结构及其在药物设计中的应用,涉及一种蛋白酶的晶体结构。提供一种肠道病毒71型的2A蛋白酶的晶体结构、底物结合凹槽、底物结合凹槽在药物分子设计中的应用、能与所述底物结合凹槽相互作用的化合物,以及二者相互作用所形成的复合物结构。所述晶体结构由氮端结构域和碳端结构域构成,所述底物结合凹槽具有由第21位组氨酸、第39位天门冬氨酸、第110位半胱氨酸所构成的催化三联体组成的催化活性中心;所述底物结合凹槽包括S4,S3,S2,S1,S1’,S2’和S3’位点在药物分子设计中的应用。所述能够与所述肠道病毒71型2A蛋白酶的底物结合凹槽相互作用的4个小分子化合物。 |
申请公布号 |
CN103088007A |
申请公布日期 |
2013.05.08 |
申请号 |
CN201310033249.8 |
申请日期 |
2013.01.28 |
申请人 |
厦门大学;上海药明康德新药开发有限公司 |
发明人 |
林天伟;黎健;蔡期湑;李宁;柳立婕 |
分类号 |
C12N9/50(2006.01)I;G06F19/16(2011.01)I;C07F9/40(2006.01)I;C07F9/572(2006.01)I;C07D401/14(2006.01)I;C12R1/93(2006.01)N |
主分类号 |
C12N9/50(2006.01)I |
代理机构 |
厦门南强之路专利事务所 35200 |
代理人 |
马应森 |
主权项 |
肠道病毒71型的2A蛋白酶的晶体结构,其特征在于由氮端结构域和碳端结构域构成;所述氮端结构域具有4个反平行的β‑折叠片,碳端结构域具有6个反平行的β‑折叠桶和1个紧密结合的锌离子;所述肠道病毒71型2A蛋白酶为(a)或(b)中的蛋白质:(a)有以下氨基酸序列的蛋白质:GKFGQQSGAIYVGNFRVVNRHLATHNDWANLVWEDSSRDLLVSSTTAQGCDTIARCNCQTGVYYCNSRRKHYPVSFSKPSLIYVEASEYYPARYQSHLMLAQGHSEPGDAGGILRCQHGVVGIVSTGGNGLVGFADVRDLLWLDEEAMEQ(b)与(a)中氨基酸序列整体相似度在50%以上的蛋白质。 |
地址 |
361005 福建省厦门市思明南路422号 |