发明名称 一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型及构建方法
摘要 本发明公开了一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型及构建方法,通过比较活动性肺结核组与健康对照组、肺炎组、肺癌组、COPD组的蛋白质组学差异,获得活动性肺结核的蛋白表达差异质谱。此外,本发明还涉及活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型构建的新方法,利用相对和绝对定量的同位素ITRAQ标记及串联质谱技术,能有效地对血清里的蛋白进行鉴定和相对定量,采用该技术能获得活动性肺结核病人血清中的蛋白表达差异质谱。
申请公布号 CN103065065A 申请公布日期 2013.04.24
申请号 CN201210499636.6 申请日期 2012.11.18
申请人 浙江大学 发明人 李继承;徐丹丹
分类号 G06F19/18(2011.01)I;G01N30/02(2006.01)I 主分类号 G06F19/18(2011.01)I
代理机构 代理人
主权项 一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型,其特征在于,该活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型包括:肺结核与健康对照组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白PDLI1、C4BPA、CD14、SAA、IGHD、IGHM、SHBG、PPIA、PZP、MASP2、PEPD、ZYX、VWF、FLNA、TAGL2、FCN2、CD5L、F13A、FHR5、HBD、IBP2、HBB、GPVI、HYOU1、TTHY、HBA、LDHB、TLN1、NPC2、TENA、HABP2、TRML1、CAH2、ITB1、C4BPB、HPT、FCGBP、PROF1、FIBB、4F2、ITIH3、SODE、FETUB_HUMAN、CALR、TIMP1和下调蛋白PLF4、RET4、APOM、LYSC、IL1AP、IBP5、FINC、APOD、ANGT、ALBU、C1R、APOC1、HGFA、NOE1、SAMP、MIME、CHLE、CPN2、TRY1、CBG、LUM、IBP1、PEDF、BTD、TETN、KLKB1、ATRN、K1C10、LYVE1、PON1、TRFE、LMAN2、NGAL、LCAT、I PSP、APOF、NRP1、GPV、K2C1、PON 3、APOA1、PHLD、ICAM2、FA11、ANAG、CO4B、GPX3、K1C9、TRFL、AFAM、COL11、SAA4、APOC2、CNDP1、APOC4构成;肺结核与肺炎组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白SAMP、CBPB2、IC1、HEP2、FLNA、AFAM、ZA2G、ANT3、KNG1、PLSL、THBG、CO5、A2AP、LUM、MASP1、LBP、HABP2、GPX3、HYOU1、PROC、CHLE、APOH、CO7、FKB1A、ATRN、TAGL2、CFAI、PROF1、RET4、C1QB、KLKB1、BTD、NEO1、PPIA、GPV、CBG、C1R、PROZ、SHBG、ANGT、PDIA1、F13B、ZPI、QSOX1、TLN1、CO8B、HRG、KAIN、LYSC、CO2、GP1BA、TETN、CPN2、CYTC、CO6A3、MBL2、PEDF、NGAL、VWF、HGFL、APOC1、TRML1、PRG4、FETUB、CAH1、CRIS3、C1RL、AMPN、PEPD、CO8G、CD14、HGFA、FCG3B、1433Z、BGH3、FCGBP、4F2、DOPO、CALR、ZYX、CRAC1、SODE、PTGDS、FA10、FHR1、C1QA、PDLI 1、IGF2、PLTP、EGLN、BST1、NOE1和下调蛋白IGHA1、HPT、IGHG3、LAC2、IGKC、SAA、ALBU、IGHM、HBA、HBB、HPTR、PLF4、HBD、C4BPA、SAA4、CRP、TTHY、IGJ、CATA、PHLD、SLPI、LG3BP、PVR、FINC、IGLL5、APOM、FIBA、TENA、APOL1、LCAT、K1C10、APOF、IBP1、PRDX2、ANAG、MA1A1、SEPP1、PODXL、SRCRL、PON1、CLUS、GGH、CXCL7构成;肺结核与肺癌组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白TAGL2、FLNA、TRML1、ALBU、PROF1、SHBG、ZYX、PDLI 1、FETUB、CYTC、KNG1、SAA、TLN1、GPVI、CXCL7、CO6A3、CRIS3、DOPO、SODE、NGAL、PPIA、PROZ、LYAM1、GP1BA、F13A、TENX、F13B、TTHY、BTD、NPC2、NCAM1、CALR、CFAD、HYOU1、CHL1、CO7、CD14和下调蛋白HPT、HPTR、HBB、HBA、C4BPA、IGHG3、LAC2、PLF4、HBD、CADH5、FINC、LG3BP、APOC2、IGHM、TRFL、SAA4、C4BPB、LBP、SLPI、PHLD、ITIH3、K2C1、A1AG2、CRP、A1AG1、ANGT、CO6、APOL1、PROS、MA1A1、IGHA1、ATRN、FCN2、COIA1、C1R、CATD、PCSK9、COL11、LCAT、CO8B、FA5、APMAP、FIBB、SAMP、APOD、PLTP、HEP2、APOC1、K1C10、HGFL、SEPP1、CO8A、CD5L_、CPN2、LMAN2、CFAI、I CAM1、TRY1构成;肺结核与COPD组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白ALBU、TAGL2、CD14、FLNA、FETUB、PROF1、TENX、SODE、COMP、ZYX、TRML1、FA10、PDIA1、KNG1、CRIS3、TLN1、PROP、GPVI、PDLI1、PPIA、FKB1A、CBG、GP1BA、CRAC1、FHR1、F13A、NPC2、IBP5、VASN、1433Z、CO4B、EGLN、PRG4、GGH、CFAD、CALR和下调蛋白HPT、IGHM、IGHG3、LAC2、HBB、HPTR、HBA、PLF4、C4BPA、HBD、IGKC、FINC、IGHA1、SAA、IGLL5、LBP、CRP、C4BPB、SAA4、ADIPO、APOC2、A1AG2、TRFL、FIBB、ITIH3、PHLD、COL11、CADH5、APOC1、APOD、CO6、IGJ、C1R、ICAM2、A1AG1、CATA、ATRN、ANGT、FIBA、APOC3、CLUS、LG3BP、PZP、PON1、ALDOB、APOL1、SEPP1、CO7、APOF、CO8B、IGHD、PRDX2、CO8A、LYVE1、CFAI、ENPL、GPNMB、CAH2、TENA、FA5、PROS、IC1、MIME、IL1AP、FCGBP、K1C10、MRC1、CPN2、CO5、GPX3、APMAP、CAH1、VWF、AFAM、CATD、FBLN3构成。
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