一种幽门螺杆菌感染个体化治疗检测基因芯片及应用

摘要

本发明涉及一种生物工程类检测产品及其用途。具体说是一种幽门螺杆菌感染个体化治疗的检测型基因芯片，该芯片能同时检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药突变位点A2142G和A2143G、喹诺酮耐药突变位点Asn87(N87K)和Asp91(D91G/Y/N)和人细胞色素酶CYP450上质子泵抑制剂代谢相关的2C19*2(G6981A)和2C19*3(G636A)位点的多态性。该芯片检测法快速、准确，可进行幽门螺杆菌病原的鉴定、克拉霉素及喹诺酮耐药分析以及质子泵抑制剂代谢个体化差异的分析，用于指导幽门螺杆菌感染“三联法”治疗的个体化用药。

主权项

1.一种幽门螺杆菌感染个体化治疗检测基因芯片，其特征在于芯片包括(1)幽门螺杆菌23s基因上的克拉霉素耐药突变位点A2142G和A2143G对应的野生型和突变型SNP分型寡核苷酸探针；(2)幽门螺杆菌gyrA基因上的喹诺酮耐药突变位点Asn87(N87K)和Asp91(D91G/Y/N)对应的野生型和突变型SNP分型寡核苷酸探针；(3)人细胞色素酶CYP450上质子泵抑制剂代谢相关的2C19*2(G6981A)和2C19*3(G636A)对应的野生型和突变型SNP分型寡核苷酸探针；(4)芯片质量控制寡核苷酸探针；(5)寡核苷酸探针固化在载体材料上形成的探针阵列。所谓的幽门螺杆菌感染个体化治疗检测基因芯片是指同时检测人CYP450代谢相关基因2C192、2C193的基因类型以及幽门螺杆菌对克拉霉素和喹诺酮类药物的耐药基因型的寡核苷酸阵列；所谓的寡核苷酸探针是指能与目的基因杂交的多聚寡核苷酸，长度十到五十个碱基；所谓的质量控制探针至少包括两种探针，即阳性对照，阴性对照：阳性对照用于检测是否正常杂交和准确定位，阴性对照用于检测杂交信号错误或污染；所谓的载体材料包括玻片、金属片、硅片、硝酸纤维素膜；SNP分型对应的15条基因探针如下表所示：表1.特异性探针序列