一种PTPN11基因突变检测特异性引物和液相芯片

摘要

发明公开了一种PTPN11基因检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对G60V位点的SEQ ID NO.24以及SEQ ID NO.25；针对D61Y/V位点的SEQ ID NO.26以及SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.28；针对E69K位点的SEQ ID NO.29及SEQ IDNO.30；针对A72T/D位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33；针对T73I位点的SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35；针对E76K/Q/A/G/V位点的SEQ ID NO.36及SEQ IDNO.37、SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39、SEQ ID NO.40、SEQ ID NO.41；针对S502P位点的SEQ ID NO.42及SEQ ID NO.43；和/或针对G503A/V位点的SEQ ID NO.44及SEQ ID NO.45、SEQ ID NO.46；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，可实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

主权项

一种PTPN11基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对PTPN11基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对G60V位点的SEQ ID NO.24以及SEQ ID NO.25；针对D61Y/V位点的SEQ IDNO.26以及选自SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28中的一条以上；针对E69K位点的SEQ IDNO.29及SEQ ID NO.30；针对A72T/D位点的SEQ ID NO.31以及选自SEQ ID NO.32和SEQ IDNO.33中的一条以上；针对T73I位点的SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35；针对E76K/Q/A/G/V位点的SEQ ID NO.36以及选自SEQ ID NO.37、SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39、SEQ ID NO.40和SEQ ID NO.41中的一条以上；针对S502P位点的SEQ ID NO.42及SEQ ID NO.43；和/或针对G503A/V位点的SEQ ID NO.44以及选自SEQ ID NO.45和SEQ ID NO.46中的一条以上；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.23；(B).有anti‑tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.47～SEQ ID NO.69，且所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。