二聚和三聚核酸染料以及相关的系统和方法

摘要

本发明提供了二聚体和三聚体核酸染料以及有关的系统和方法。这种染料可形成发夹样结构，该结构使得所述染料通过(例如)请求式释放机理使核酸着色。例如，这种染料在没有核酸存在下的背景荧光低，在有核酸存在下，与核酸结合后的荧光高。本发明提供的染料可用于各种领域，例如实时PCR中的DNA定量测定。

主权项

1.一种具有下式的化合物：其中：Q₁是荧光核酸染料成分；Q₂是荧光核酸染料成分；Q₁和Q₂可以是相同或不同的；其中(i)Q₁和Q₂各自独立是具有式II所示结构的不对称花青染料：式II式II中，R₁'是H；具有包括端点的1个碳-6个碳的烷基或烯基；卤素；-OR₉；-SR₁₀；-NR₁₁R₁₂；-CN；-NH(C=O)R₁₃；-NHS(=O)₂R₁₄；-C(=O)NHR₁₅；与小沟结合有关的取代基；或表示桥与该结构相连之处；当式II中的R₁’包括R₉、R₁₀、R₁₁、R₁₂、R₁₃、R₁₄和R₁₅中至少一个时，R₉、R₁₀、R₁₁、R₁₂、R₁₃、R₁₄和R₁₅中任何一个所述基团独立为H；任选含有包括端点的1-2个氮且具有包括端点的1个碳-12个碳的烷基；或芳基；当式II中的R₁’包括R₁₁和R₁₂时，R₁₁和R₁₂可组合形成5-或6-元饱和或不饱和环，该环可任选含有至少一个选自N和O的杂原子；式II中的X选自O和S；式II中的n选自0、1和2；式II中的R₆是H；任选含有至少一个选自N、O和S的杂原子，具有包括端点的1个碳-10个碳的烷基或烯基；卤素；-OR₁₆；-SR₁₆；-NR₁₆R₁₇；任选含有包括端点的1-3个选自N、O和S的杂原子的取代或未取代芳基；或表示桥与该结构相连之处；式II中的R₇是H；任选含有芳基和至少一个选自N、O和S的杂原子，具有包括端点的1个碳-10个碳的烷基或烯基；任选含有包括端点的1-3个选自N、O和S的杂原子的取代或未取代的芳基；或表示桥与该结构相连之处；式II中的R₈和R₈’组合形成稠合芳环，该芳环还可独立地用包括端点的C₁-C₂烷基、包括端点的C₁-C₂烷氧基、包括端点的C₁-C₂烷基巯基或卤素取代包括端点的1-4次；所述R₁₆和R₁₇各自独立为H；或任选含有1-2个氮，具有包括端点的1个碳-12个碳的烷基；或芳基；R₁₆和R₁₇可组合形成5-或6-元饱和或不饱和环，该环可任选含有至少一个选自N和O的杂原子；式II中的R₁’、R₆、和R₇中只有一个表示桥与该结构相连之处；和式II中的Ψ是阴离子；或(ii)Q₁和Q₂各自独立地是具有式III的结构的吖啶染料：式III其中，式III中的各R₁独立为H或包括端点的C₁-C₂烷基；式III中的R₂和R₃之一表示桥与该结构相连之处；当式III中的R₂表示桥与该结构相连之处时，R₃是H或-CH₃；当式III中的R₃表示桥与该结构相连之处时，R₂选自H、-CH₃、-NH₂、-NHCH₃、-CN和-C(=O)NH₂；式III中的各R₆独立为H或包括端点的C₁-C₂烷基；式III中的各R₇独立为H或包括端点的C₁-C₂烷基；对于各对毗邻的R₆或R₇和R₁，R₆或R₇和R₁可独立组合形成5-或6-元饱和或不饱和环；和式III中的Ψ是阴离子；和桥是含有约8至约150个非氢原子的实质上脂族的接头，并且该接头包含不超过一个正电荷。