主权项 |
基于机器码识别技术的血液病原菌标准菌株的编码方法,其特征在于:包括如下步骤:a.针对七种病原菌16SrDNA和23SrDNA的保守区域设计通用引物并荧光标记;所述七种病原菌为:金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、表皮葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、粪肠球菌和肺炎链球菌;所述通用引物序列为:上游引物:5’‑TTGTAAATACCGCCCGTCA‑3’,下游引物:5’‑GGTTGCTTAGATGGTTCAGTTC‑3’;b.对内参照体系进行CE‑SSCP分析,得内参照的CE‑SSCP电泳图;所述内参照体系由9μl去离子甲酰胺、0.5μl浓度为3M的NaOH和0.5μl ROX 500混合而得;所得内参照的CE‑SSCP电泳图中,每两相邻峰之间的区域分别记为一个区间;CE‑SSCP分析所用筛分介质为POP‑7胶,CE‑SSCP分析过程中的电泳参数为:进样电压15.0KV,电泳电压13.0KV,电泳温度35℃;c.分别提取所述七种病原菌标准菌株的基因组DNA,以该基因组DNA为模板,采用步骤a所得通用引物进行PCR扩增,所得扩增产物转移至步骤b所述的内参照体系中进行CE‑SSCP分析,得七种病原菌标准菌株的CE‑SSCP电泳图;分别将七种病原菌标准菌株的CE‑SSCP电泳图与内参照的CE‑SSCP电泳图进行比对并按照二进制编码方法进行编码,出现病原菌峰的区间记为1,未出现病原菌峰的区间记为0,然后将二进制编码转化为十进制编码,即得七种病原菌标准菌株CE‑SSCP电泳图的十进制编码结果;所述PCR扩增的循环 参数为:94℃预变性5min;94℃变性40s,54℃退火45s,72℃延伸40s,共30个循环;72℃终延伸5min,结束PCR扩增。 |