丙型肝炎病毒基因分型及IL28位点多态性检测试剂盒

摘要

本发明涉及检测丙型肝炎病毒基因型及IL28位点多态性的试剂盒，特别是涉及使用核酸反向斑点杂交技术制备一种丙型肝炎病毒基因型及IL28位点多态性检测试剂盒，该试剂盒由扩增试剂、以尼龙膜为载体的低密度芯片、杂交试剂三部分组成，可同时检测HCV基因型及与HCV治疗密切相关的IL28B基因多态性，为丙型肝炎个体化治疗提供更为可靠的依据。

主权项

一种检测丙型肝炎病毒基因型及IL28B多态性的试剂盒，由扩增试剂、以尼龙膜为载体的低密度芯片、杂交试剂三部分组成，其特征在于扩增试剂中逆转录引物HCV‑RT、HCV分型PCR扩增引物HCV‑F和HCV‑R、IL28B多态性PCR扩增引物IL28B‑F和IL28B‑R的序列分别是：HCV‑RT：5′‑GCTCATGGTGCACGGTCTACGAGACCT‑3′HCV‑F：5′‑TCTAGCCATGGCGTTAGTATGAGTGT‑3′HCV‑R：5′‑CACTCGCAAGCACCCTATCAGGCAGT‑3′IL28B‑F：5’‑AGTCTGGGATTCCTGGACGTGG‑3’IL28B‑R：5’‑GGCTCAGGGTCAATCACAGAAGGGAG‑3’；点在低密度芯片的HCV基因型特异性探针的序列为：HCV‑1：5′‑CAATGCCTGGAGATTTGGGCG‑3′HCV‑1b‑1：5′‑CCGCGAGACTGCTAGCCG‑3′HCV‑1b‑2：5′‑GCGAGACCGCTAGCCGAGT‑3′HCV‑2‑1：5′‑AGTAGCGTTGGGTTGCGAAAG‑3’HCV‑2‑2：5′‑GTCCTTTCTTGGATAAACCCAC‑3′HCV‑2a‑1：5′‑GCCGGGAAGACTGGGTCCT‑3′HCV‑2a‑2：5′‑CCCACTCTATGCCCGGCCA‑3′HCV‑3‑1：5′‑CCCGCGAGATCACTAGCCG‑3′HCV‑3‑2：5′‑AATCGCTGGGGTGACCGGG‑3′HCV‑3b：5′‑CGCGCTCAATGCCCGGAAAT‑3′HCV‑PC1：5′‑ATTTGGGCGTGCCCCCGC‑3′HCV‑PC2：5′‑CGGAACCGGTGAGTACACC‑3′HCV‑IC：5′‑GCCGTAACCGTCACAATCCGT‑3′；点在低密度芯片的IL28B多态性位点的特异性探针的序列为：rs12979860‑C：5’‑CGAAGGCGCGAACCAGGG‑3’rs12979860‑T：5’‑GAAGGCGTGAACCAGGGTTG‑3’。