一种与油菜含油量性状紧密连锁的分子标记及应用

摘要

本发明公开了一种与油菜含油量性状紧密连锁的分子标记及应用，一种与油菜含油量性状紧密连锁的分子标记BrSF34-123，筛选步骤为：1）甘蓝型油菜品种zy036和51070杂交获得DH代分离群体；2）设计引物对亲本进行多态性筛选，构建遗传连锁图谱；3）通过对DH分离群体进行田间实验和考种获得含油量的表型数据；4）结合开发的高密度分子标记遗传连锁图谱，以及分离群体的基因型和含油量表型数据进行QTL检测，获得一种与油菜含油量性状紧密连锁的分子标记。因此利用该标记进行辅助选择，可以快速筛选高含油量株系用于油菜含油量育种，育种选择目标明确，节约成本。

主权项

一种与油菜含油量性状紧密连锁的分子标记，其筛选步骤是：a)油菜品种zy036和51070进行杂交，在杂种F1代利用小孢子技术产生加倍单倍体代分离群体；b) 采用十六烷基三甲基溴化铵法提取亲本zy036和51070及DH代分离群体的叶片总DNA；c) 搜集油菜公开数据库的SSR并自主开发SSR、IFLP、SNP和InDel引物，对亲本DNA进行  PCR扩增，产物在变性或非变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳，染色和显影后对条带的大小进行判别，筛选多态性引物；d) 利用多态性引物对DH分离群体进行分子标记基因型分析，利用Joinmap3.0软件进行遗传图谱的构建，作图参数设为重组率<0.4，LOD>1.0；利用WinQTL Cartographer 2.5软件进行数量性状位点定位，LOD阈值用1000次的置换测验确定，概率水平P＝0.05，检测到1个位于油菜第2连锁群 A2控制含油量的QTL，与其性状紧密连锁的SSR标记为BrSF34‑123，该分子标记位于甘蓝型油菜第2连锁群A2的140.6cM处，其引物序列为BrSF34‑123F：5’‑CCCCTGCAATTTGTAACCAC‑3’，BrSF34‑123R：5’‑CCCTTTTGAACAAGGTACGC‑3’；此SSR标记在zy036的扩增片段为129个bp，其核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示。