发明名称 |
应用生物信息学快速鉴定番木瓜抗白粉病基因 |
摘要 |
本发明是快速鉴定番木瓜抗白粉病基因;涉及到植物比较基因组学,遗传学和生物信息学等学科知识,属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为:1)番木瓜全基因组序列的下载及MLO型基因的采集;2)MLO型基因的鉴定;3)MLO型基因系统发育关系;4)MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了番木瓜白粉病基因挖掘周期,有利于白粉病基因的快速鉴定;通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等),还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择,准确性高;结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制,缩短育种年限,提高育种效率;为阐述番木瓜抗白粉病分子机制奠定了基础。 |
申请公布号 |
CN102719448A |
申请公布日期 |
2012.10.10 |
申请号 |
CN201210095040.X |
申请日期 |
2012.03.31 |
申请人 |
常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 |
发明人 |
钱孝英;俞锞 |
分类号 |
C12N15/29(2006.01)I;C07K14/415(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12N15/29(2006.01)I |
代理机构 |
苏州广正知识产权代理有限公司 32234 |
代理人 |
张利强 |
主权项 |
番木瓜抗白粉病基因,其特征在于选自下列2个基因(片段)或其之一:1、evm.TU.supercontig_53.58氨基酸序列:VCFFRQFFGSVTKVDYLTLRHGFIAAHLPPGSETKFDFQKYIKRSLEEDFKVVVGISPVIWFIAVLFLLTNTHGWFSYLWFPFIPLIVILLVGAKLQVTITKLGLRIQERGDVVKGAPVVQPGDDLFWFGRPQFILFLIHLVLFTNAFQLAFFIWATYEFTIRTCFHQRLEDIIIRISMGVLIQVLCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNERVATALKSWRQTAKKHTKHGRNSEATTPFSSRPTTPTHGMSPVHLLHNYNHRSVDSYQNSPRNSNFDNDQWDPEALQNSPGYHEISDSDEAKHSDSLGGQNRPAMAEPVSGQLPPGPAAIRTQREINIGSSEFSFSK核苷酸序列:GTCTGTTTCTTCAGACAGTTCTTTGGATCAGTTACCAAAGTTGATTACCTCACACTCAGACATGGATTTATCGCGGCACATTTGCCACCCGGTAGCGAAACCAAATTCGATTTCCAGAAGTACATTAAGAGATCATTAGAAGAGGATTTCAAAGTTGTGGTGGGGATCAGTCCTGTTATCTGGTTCATTGCTGTATTGTTTCTTCTAACTAATACTCATGGATGGTTTTCATATCTTTGGTTCCCATTTATCCCCTTAATTGTAATTTTGCTGGTTGGAGCCAAACTTCAAGTTACAATAACAAAATTGGGATTGAGGATTCAAGAGAGGGGAGATGTGGTTAAAGGCGCTCCAGTTGTCCAGCCCGGAGACGATCTTTTCTGGTTCGGACGTCCTCAATTTATCCTCTTCTTAATTCATCTCGTACTCTTTACGAATGCATTTCAGCTTGCTTTCTTCATCTGGGCAACGTACGAGTTTACCATAAGAACCTGCTTCCACCAACGATTGGAAGATATCATTATTAGAATCTCCATGGGGGTCCTCATACAGGTTCTTTGTAGTTACGTGACTCTGCCTCTCTACGCACTTGTGACCCAGATGGGATCGACAATGAAACCTACAATTTTCAACGAGAGAGTAGCAACGGCACTTAAAAGTTGGCGTCAAACAGCAAAGAAACACACGAAACACGGTAGGAATTCCGAGGCTACGACGCCATTTTCTAGCCGGCCAACAACTCCTACCCACGGCATGTCACCAGTTCATCTCTTGCACAATTACAATCACCGCAGTGTTGACAGCTACCAAAACTCTCCGAGGAATTCCAACTTCGACAACGATCAATGGGATCCCGAGGCGTTGCAAAATTCTCCGGGATATCACGAGATAAGTGACTCCGATGAAGCCAAACATTCGGATAGTCTTGGAGGACAAAATAGGCCAGCAATGGCAGAACCAGTCTCCGGTCAGCTGCCTCCGGGGCCTGCTGCTATTAGGACGCAACGAGAAATCAATATAGGTTCATCAGAATTCAGCTTCAGCAAGTGA2、evm.TU.supercontig_435.5氨基酸序列:MAGASGGRSLEETPTWAVAVVCFVLVFISICIEYIFHLIGKWLKKKRKRALYESLEKIKSELMLMGFVSLLLTVGQGLISNICIPKSIGATWHPCNKKQEEESEKVDDDSDLEHRRRLLSAVTHSGEGFRRVLAAASTDKCAEKGKVPFVSEEGIHQLHIFIFVLAVSHVLYCIITMALGRAKMRSWKSWEKETRTVEYQFSHDPERFRFARETSFGRRHLSFWTKTPVFIWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFITAHLAPQSHTKFDFQKYINRSLEEDFKVVVGISPPIWFFAVLFLLFNTHGWYSYLWLPFIPLIIILLVGTKLQVIITKMGLRIQERGEVVKGVPVVQPGDDLFWFNRPRLILFLINFVLFQNAFQLAFFAWTWYEFGIKSCFHENVEDIVIRISMGVLIQILCSYVTLPLYALVTQMGSNMKPTIFNERVAAALRNWHHTAKKHVKQNKGSVTPFSSRPNTPSHYASPIHLLRHNPDSLQTTPRMSNFDNNDLSETESQSPSPSHGRYHQGEGSSSSHHPHNNFPDQDYRDHERNSVQDFNHEQHEIEISLKDFSFDRKASR核苷酸序列:ATGGCAGGAGCTAGCGGAGGAAGATCCTTGGAGGAGACACCTACTTGGGCTGTTGCTGTTGTTTGTTTCGTTCTGGTTTTCATTTCTATTTGTATCGAGTACATATTCCATCTCATCGGCAAGTGGTTGAAGAAGAAACGCAAGAGAGCTCTGTACGAATCACTTGAAAAGATCAAATCAGAGCTTATGTTAATGGGGTTCGTGTCGCTGCTGCTCACAGTCGGGCAAGGTCTCATATCGAACATATGCATACCGAAGTCAATTGGAGCCACGTGGCATCCCTGCAACAAGAAGCAAGAGGAGGAATCGGAGAAAGTCGACGACGACTCCGACCTCGAGCATCGCCGGAGACTCCTCTCTGCGGTAACTCATTCCGGTGAAGGTTTCCGGCGAGTTTTGGCCGCTGCCTCTACTGATAAATGTGCCGAAAAGGGCAAAGTCCCATTTGTATCCGAAGAAGGCATTCACCAACTCCACATCTTCATTTTTGTCTTGGCCGTTTCCCATGTCCTTTACTGTATTATCACCATGGCTTTGGGCAGAGCTAAGATGAGAAGCTGGAAATCATGGGAGAAGGAAACTAGAACCGTCGAGTATCAGTTCTCACACGATCCAGAAAGGTTTAGGTTTGCTAGAGAGACATCATTTGGAAGAAGACACTTGAGCTTCTGGACAAAAACACCTGTGTTCATATGGATTGTTTGTTTCTTCAGGCAATTTGTTAGGTCTGTGCCGAAAGTTGACTATTTGACCCTCAGACATGGATTTATTACGGCACATTTAGCACCACAGAGCCACACAAAATTTGATTTCCAAAAATACATCAATAGATCCCTTGAAGAGGATTTCAAGGTTGTGGTCGGGATTAGTCCACCCATATGGTTCTTTGCCGTGCTATTCTTGCTATTTAACACTCATGGCTGGTATTCGTATCTATGGCTACCCTTTATCCCTTTGATCATAATCCTGCTAGTGGGAACCAAGCTGCAAGTGATAATAACAAAGATGGGACTTAGAATTCAAGAAAGAGGAGAAGTGGTGAAGGGTGTCCCTGTAGTTCAGCCCGGCGATGACCTTTTCTGGTTTAACCGACCAAGACTCATTCTTTTCCTCATTAATTTCGTTCTTTTTCAGAATGCATTTCAACTTGCTTTCTTTGCATGGACTTGGTATGAATTCGGAATTAAGTCTTGTTTCCATGAAAATGTGGAAGATATTGTCATCAGAATTTCTATGGGGGTTCTCATACAAATTCTATGCAGCTATGTTACTCTCCCTCTCTATGCTCTTGTCACACAGATGGGATCAAACATGAAGCCAACAATATTCAATGAAAGAGTAGCTGCAGCCTTGAGAAATTGGCACCATACCGCAAAGAAACATGTCAAGCAGAATAAAGGATCTGTAACCCCTTTTTCCAGCAGACCAAACACGCCCTCGCACTACGCCTCTCCTATCCATCTCTTGAGACACAATCCGGACAGCCTCCAAACGACTCCGAGAATGTCAAATTTCGATAATAACGATCTCTCAGAGACCGAGTCTCAATCTCCATCTCCGTCCCATGGCCGCTATCACCAAGGCGAAGGATCGTCCTCCTCTCATCATCCCCACAACAATTTCCCCGATCAAGATTACAGGGACCACGAGAGAAATTCAGTTCAAGATTTTAATCACGAGCAACACGAAATTGAGATTAGTCTTAAAGACTTTTCGTTTGATCGAAAAGCGAGTCGATGA。 |
地址 |
215500 江苏省苏州市常熟市支塘镇工业园区常生路 |