发明名称 一种检测基因突变的方法
摘要 本发明公开了一种检测基因突变的方法。本发明提供了一种DNA分子测序的方法,包括如下步骤:(1)得到目的待测双链DNA分子;(2)磷酸化;(3)在DNA聚合酶的作用下,单链DNA分子1的5’端区域与3’端区域通过与单链DNA片段丙的分子条码区域互补的核苷酸连接成环;(4)用核酸外切酶消化;(5)滚环复制;(6)粘末端补平;(7)用核酸外切酶消化;(8)超声破碎;(9)末端修复和缺口连接;(10)磷酸化;(11)第一次测序;(12)第二次测序,读取分子条码信息;(13)获得结果。本发明可用于病原微生物变异的高灵敏性检测和病原微生物混合感染的快速甄别。
申请公布号 CN102676654A 申请公布日期 2012.09.19
申请号 CN201210072772.7 申请日期 2012.03.19
申请人 中国科学院微生物研究所 发明人 杨怀义;朱鈞;倪挺;刘翟
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人 关畅
主权项 一种DNA分子测序的方法,包括如下步骤:(1)以来自一个待测样本的双链DNA分子为模板,用单链DNA片段甲和单链DNA片段乙组成的引物对进行PCR扩增,回收PCR扩增产物,得到目的待测双链DNA分子;所述目的待测双链DNA分子由单链DNA分子1和单链DNA分子2组成,且单链DNA分子1和单链DNA分子2反向互补;所述单链DNA片段甲为所述单链DNA分子1的5’端区域;所述单链DNA乙包括所述单链DNA分子2的5’端区域;(2)将步骤(1)的PCR扩增产物进行磷酸化;(3)将步骤(2)的产物单链化并与单链DNA片段丙及dNTP共孵育,所述单链DNA分子1的5’端区域与所述单链DNA片段丙的3’端区域配对形成双链,所述单链DNA分子1的3’端区域与所述单链DNA片段丙的5’端区域配对形成双链;在DNA聚合酶的作用下,所述单链DNA分子1的5’端区域与3’端区域通过与所述单链DNA片段丙的分子条码区域互补的核苷酸连接成环;所述单链DNA片段丙自5’末端至3’末端依次包括三个区域:所述单链DNA分子2的5’端区域、分子条码区域和所述单链DNA分子2的3’端区域;所述分子条码区域由选自A、T、C和G的10至16个核苷酸组成;(4)将步骤(3)的产物用核酸外切酶进行消化,去除没有成环的单链DNA分子;(5)以步骤(4)的产物为模板进行滚环复制;(6)将步骤(5)的产物的粘末端补平;(7)将步骤(6)的产物用核酸外切酶进行消化,去除单链DNA分子;(8)将步骤(7)的产物进行超声破碎并回收与待测双链DNA分子大小近似的片段;(9)将步骤(8)回收的片段进行末端修复和缺口连接;(10)将步骤(9)的产物进行磷酸化;(11)将步骤(10)的产物进行第一次测序;(12)完成步骤(11)后,以所述单链DNA片段甲为测序引物进行第二次测序,读取分子条码信息;(13)将具有相同分子条码的测序结果进行拼接,每种分子条码获得一个具体的测序结果。
地址 100101 北京市朝阳区北辰西路1号院3号