主权项 |
一种DNA分子测序的方法,包括如下步骤:(1)以来自一个待测样本的双链DNA分子为模板,用单链DNA片段甲和单链DNA片段乙组成的引物对进行PCR扩增,回收PCR扩增产物,得到目的待测双链DNA分子;所述目的待测双链DNA分子由单链DNA分子1和单链DNA分子2组成,且单链DNA分子1和单链DNA分子2反向互补;所述单链DNA片段甲为所述单链DNA分子1的5’端区域;所述单链DNA乙包括所述单链DNA分子2的5’端区域;(2)将步骤(1)的PCR扩增产物进行磷酸化;(3)将步骤(2)的产物单链化并与单链DNA片段丙及dNTP共孵育,所述单链DNA分子1的5’端区域与所述单链DNA片段丙的3’端区域配对形成双链,所述单链DNA分子1的3’端区域与所述单链DNA片段丙的5’端区域配对形成双链;在DNA聚合酶的作用下,所述单链DNA分子1的5’端区域与3’端区域通过与所述单链DNA片段丙的分子条码区域互补的核苷酸连接成环;所述单链DNA片段丙自5’末端至3’末端依次包括三个区域:所述单链DNA分子2的5’端区域、分子条码区域和所述单链DNA分子2的3’端区域;所述分子条码区域由选自A、T、C和G的10至16个核苷酸组成;(4)将步骤(3)的产物用核酸外切酶进行消化,去除没有成环的单链DNA分子;(5)以步骤(4)的产物为模板进行滚环复制;(6)将步骤(5)的产物的粘末端补平;(7)将步骤(6)的产物用核酸外切酶进行消化,去除单链DNA分子;(8)将步骤(7)的产物进行超声破碎并回收与待测双链DNA分子大小近似的片段;(9)将步骤(8)回收的片段进行末端修复和缺口连接;(10)将步骤(9)的产物进行磷酸化;(11)将步骤(10)的产物进行第一次测序;(12)完成步骤(11)后,以所述单链DNA片段甲为测序引物进行第二次测序,读取分子条码信息;(13)将具有相同分子条码的测序结果进行拼接,每种分子条码获得一个具体的测序结果。 |