Verfahren zum Identifizieren einer Teilmenge von Polynucleotiden aus einer dem Humangenom entsprechenden Ausgangsmenge von Polynucleotiden zur in vitro Bestimmung eines Schweregrads der Wirtsantwort eines Patienten

摘要

Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zum Identifizieren einer Teilmenge von Polynucleotiden aus einer dem Humangenom entsprechenden Ausgangsmenge von Polynucleotiden zur in vitro Bestimmung eines Schweregrads der Host Response eines Patienten, der sich in einem akut infektiösen und/oder akut inflammatorischen Zustand befindet, in einer Probe, wobei eine Messvorrichtung verwendet wird, die eine Vielzahl von unterschiedlichen Gensonden aufweist, welche das im Wesentlichen gesamte Humangenom repräsentieren, wobei die Probanden je nach ihrem Infektions- und/oder Inflammationsstatus in wenigstens zwei der klinisch ermittelte Phänotypgruppen eingeteilt werden, die Änderungen der Genexpressionssignale zwischen den Phänotypgruppen statistisch verglichen werden und solche Gensonden ausgewählt werden, deren Genexpressionssignale zwischen mindestens zwei Phänotypgruppen statistisch signifikant verändert sind. Daraus wird ein Master-Score als Maß für den Schweregrad der Host Response ermittelt und es wird eine im Vergleich zur Ausgangsmenge erheblich reduzierte Anzahl von Polynucleotiden durch Ermittlung eines Scores identifiziert, der eine vorgegebene Abweichung vom Master-Score nicht überschreitet. Dieser Score kann zur Diagnose, Vorhersage der Entwicklung oder der Überwachung eines akut infektiösen und/oder inflammatorischen Zustandes eines Patienten und/oder der Therapieverlaufskontrolle und/oder zur Fokuskontrolle, verwendet werden.