发明名称 一种基于<sup>18</sup>O标记的N-糖链相对定量方法
摘要 本发明属分析化学技术领域,具体为一种基于18O标记的N-糖链相对定量方法。具体是将糖苷内切酶催化生成的同位素18O标记的N-糖链与糖苷内切酶催化生成的不标记的N-糖链按等摩尔比混合为溶液,由生物质谱检测峰强度,再经计算消除同位素峰重叠后,进行相对定量。本发明成功解决了同位素18O标记的糖链与不标记的糖链在质谱中同位素峰重叠的问题。本发明在两个数量级的动态范围内,取得了良好的线性和较低的变异系数,为糖苷内切酶催化同位素标记N-糖链的方法在定量糖组学中的应用提供了有效的修正和计算方法。
申请公布号 CN101907603B 申请公布日期 2012.09.05
申请号 CN201010233232.3 申请日期 2010.07.19
申请人 复旦大学 发明人 汪泓;张伟;杨芃原
分类号 G01N27/62(2006.01)I;C12Q1/34(2006.01)I 主分类号 G01N27/62(2006.01)I
代理机构 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人 陆飞;盛志范
主权项 一种基于18O标记的N‑糖链相对定量方法,其特征在于,将糖苷内切酶催化生成的同位素18O标记的N‑糖链与糖苷内切酶催化生成的不标记的N‑糖链按等摩尔比混合为溶液,由生物质谱检测峰强度,再经计算消除同位素峰重叠后,进行相对定量;其中溶液体系为50%乙腈0.1%三氟乙酸的水溶液;其中,由生物质谱检测到的峰强度,按下列公式计算消除同位素峰重叠: <mrow> <mi>ratio</mi> <mrow> <mo>(</mo> <mfrac> <mmultiscripts> <mi>O</mi> <mprescripts/> <none/> <mn>16</mn> </mmultiscripts> <mmultiscripts> <mi>O</mi> <mprescripts/> <none/> <mn>18</mn> </mmultiscripts> </mfrac> <mo>)</mo> </mrow> <mo>=</mo> <mfrac> <mrow> <msub> <mi>I</mi> <mi>A</mi> </msub> <mo>-</mo> <mfrac> <msub> <mi>I</mi> <mrow> <mi>b</mi> <mo>-</mo> <mn>2</mn> </mrow> </msub> <msub> <mi>I</mi> <mi>b</mi> </msub> </mfrac> <msub> <mi>I</mi> <mi>B</mi> </msub> </mrow> <mrow> <msub> <mi>I</mi> <mi>B</mi> </msub> <mo>-</mo> <mfrac> <msub> <mi>I</mi> <mrow> <mi>a</mi> <mo>+</mo> <mn>2</mn> </mrow> </msub> <msub> <mi>I</mi> <mi>a</mi> </msub> </mfrac> <msub> <mi>I</mi> <mi>A</mi> </msub> </mrow> </mfrac> </mrow>其中ratio(16O/18O)表示消除同位素峰重叠后得到的定量结果,即不标记的糖链与同位素18O标记的糖链的比例,IA表示不标记的糖链峰强度,IB表示同位素18O标记的糖链峰强度,Ia+2/Ia表示不标记的糖链中分子量加2道尔顿的同位素峰强度所占比例,Ib‑2/Ib表示同位素18O标记的糖链中分子量减2道尔顿的同位素峰强度所占比例。
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