霍山石斛微卫星DNA分子标记

摘要

本发明公开了一种霍山石斛微卫星DNA分子标记，包括霍山石斛微卫星(CT)n富集文库的构建，微卫星序列阳性克隆的筛选及测序，得到51个含有微卫星重复序列的克隆，筛选得到了11个高多态性的微卫星分子标记Hs39、Hs40、Hs41、Hs42、Hs44、Hs47、Hs48、Hs50、Hs54、Hs56、Hs57，其中Hs42可较好地区分霍山石斛与铁皮石斛、铜皮石斛、扁黄草石斛和钩状石斛。采用本方法开发的微卫星分子标记可用于研究霍山石斛的遗传多样性，鉴别霍山石斛几种伪品，具有准确、快速、重复性好的优点，为霍山石斛的去伪存真提供了新的工具。

主权项

霍山石斛微卫星DNA分子标记，其特征在于：所述微卫星标记的标号分别为：Hs39、Hs40、Hs41、Hs42、Hs44、Hs47、Hs48、Hs50、Hs54、Hs56、Hs57；其核苷酸序列分别为：Hs39：gatcagactt ccttccaact gccaaccacc gcctgacttt cacctgacca ccactcgata     60gtcaattgtc gttagatcac cgcttgtcca tcaaacttct gcccttaagc tatcggactt    120ccgcctgact gctgccagat ttctactcaa ctctccaaac tattataatt ccacaaccta    180taagttaaag gacgggtcaa cctttgtaat taactcacat ttagtgaaat cttttcatct    240aggagaggcc tcatggtttt tcccactatg ggttttccac ataaaaaaat ctgttgtttt    300acttctctct ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctctcaaatt    360acatgtttgt atgttggata tccgtgtatt gctaagatga aaaatttaca cgctcaacca    420ttgcgaatat tctaacttgc aacaatgaca aaagtcaaac aaagtcaaac ataaaatgtg    480cctttcccta atagtaatca tataacaaca atgactcata atctttttac tattatggct    540ccaagaatat tgttctaaaa tattttcata atcaactaca tgcaagctgc acctcaccat    600Hs40：gatcagagtt caacgccagat tagaaaagtc cttgtagagg ccatcacccc ggcggagggc    60gcggcatccc cacaggagaa ggtcaggttt gacaagtaat gtcaaaagat gatgaaatta    120ttacgtgcaa gcacaggacg tcgtccagag gcgaattaga acgcgccacg ttaccattta    180ctatataaca gagtgatgtg aagcatcttg attcgcctct gaactgtccg gtaactgcac    240attataattt ctcccaaaga tgacatagga cgaggtgtgg aggcagagca gaaaggcatc    300agatagcatc atggagataa tggtggagga agaagaggat tagaggcata gggagagtag    360aggaggaata gaggtttctt gttgggggga atggatagat ttgtcattaa gattgaggcg    420atgttgtcag gcaaagactt tgtacagtca attatttttc cacaactcag cgtctatcat    480tatacttgta ccaccttcat tttgcaacat taaaaatgta ttctctctct ctctctctct    540ctctctctct ctctctctct catacgcatc tctcaaaatt cacatatact tagagagatg    600ttcaacctga catatttata caaatacaag tgttagaatg aattgaatac cacaaattcc    660agcaagtttg aagcagccac taactgattt tatt                                694Hs41：gatcaacctc tggtatcact tcgagctcta ttgttcttcc attaatcttc ctcttcagat     60agtatgctac cagttcttca tctgtcggat gaaagcgaaa gccaggcggc agagttacag    120gcgccatttt tgtactgtta aatctcttat caatcctctt ttgacttttc tccctctaag    180ctctgcttca aaaaaaccat taaaactatc tcttgatttg aacatagtca gacagaaaat    240aacagaagga gagagagaga gcataccaaa tctcacataa gagagagaga gagagagaga    300gagagagaga gagagagaga gagagagaga gggcggcggt ttaagaacct ctgtagcttt    360ataaaggcaa gaaggttgct ttcctcgcaa tcgagccttt actctctctc tctactttgt    420tttgctttgg ctttatatcc aaatattctg agattattgt cctttccttc atgagccatt    480ggtccacgtg gatggacgcc att                                            503Hs42：gatcgccaca aaacatcagc cgcaaataca tgaagtatgg aagctcaacg agattccatc     60tatccatcaa ctaagcacac acagagagag agagagagag agagagagag agagagagag    120agagagacct cctgttggaa ctctcgttgg ccttgaatac tatgatgatg aaacttcttt    180attgccacac ttctgttcaa catttccccc ttatatacac atcccagtcc tccctgtcct    240atcataaagg catctgagaa accaaaggct gcagtttgca agtctgatag tggaaactcc    300ttgaaatcaa gagaatcgct tcctaagtca ataaacttat tgcatatttt ggattttctg    360cgatggttgc atctcaacct ttcaatctgc tgaacatact cgtctctctg atgttggatt    420ttctgatttt caagcttaag cgctgctata gaagacatgg ttgaatccaa ttcaacagtt    480gccttatctt tacgatgaaa catttcacga acacgaacat caaggatagc tacattttcc    540attgtacttt gaagttcttt catgcttttt tctatttggt tcactagctc gttctgcttc    600aacttggtaa ctactatgag ctcttcaagc tcttctct                            638Hs44：gatcgggcta caacattact tggatttact acatttttgg atgtgttgac tactaactag     60ccttatcggc cccacctcga cgtttctctc tcaaacgaag caatggttcg ctcatataac    120tcccacttat ggcataaaac ctccccgccc tctctctctc tctctctctc tctctctctc    180tccattcgac tctcatgtag gaactgccca ctagcccctc ttgcttttct ccctcattcg    240catgcgagga gtgctcgact ctacctattc gttcgcatga ccttgtacat gagaccctag    300ccttgtcctc tctcgtttta ttgaccgtgc acccaagtaa cttagatgcg attgtccgct    360cacgtctccg tctcttcctc cacgtgtccc aaactcagct acgcatgatc cctaacctga    420aacccctcgt tctcttt                                                   437Hs47：gatcacaaat gctgaaacat cctagcaaat tatacagttc atttcaattt gtgtggacaa     60gcaaaataac ttaatttttt tttccctcca agagtgggcc ggttgagaaa tcaagtagag    120gcaccaatag ctgcatccat ctctgtagag ttctttatca agttcttgct tgaaggcaac    180ccagcaacga cattcgcttc aatgccacat tcatttgtcc ctcttaaaat cttgaaatag    240ccatcctgaa gagaaaacat aaaaaatttt gatagacaag tgttaccaaa actaaaccat    300acacaaattt tgccaagtat tattttgaaa catacatcac cccaatttct attccactgg    360ttagcaagta gctgcaaaac aaatataaga gataacaaaa aaattgtatc agaattggat    420ttaatctgta aaatgtaaaa gaaatgtgtg tgtgtgtgtg tgtgagagag agagagagag    480agaactcaaa cccaataatc ttctccttgc tcactagtgc cccatccaat taacttaaca    540gcatgtccac ctaagacatc acctgtgata tatctgtaaa ctccagattt gtagtgggca    600aaatcctgtt tataagaaaa taaaaatcag gtgacctgct tgattatatt gtaggattca    660ttataataaa gtaaaattaa acaatgaaaa tttctatctt ttgc                     704Hs48：atcagcaaga gaagaattat agatatatag ccgatataaa taaagctcat gttgggatgt     60tcaggagtag tccatttgtt gagcacctaa accaacttca atttcctttt gcactttttt    120atgaaccctt tatttggcat cctcaaggga aaggccgtaa tgatgataat gagaatccag    180actctgatgg ttaggagtct ttacatttct tcgcttgtat gtgtatgtgt gtgtgtgtgt    240gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtttgtgtgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt    300gtgagagaga gagagagaga gagagagaga gagagaga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