一种携带荧光素酶报告基因的HSV-1 BAC系统的构建方法

摘要

本发明公开了一种携带荧光素酶报告基因的HSV-1BAC系统的构建方法，步骤是：A、构建系统：(1)根据HSV-1F株序列设计引物；(2)构建转移载体；（3）构建重组病毒；(4)噬斑纯化；（5）重组病毒的鉴定：（6）构建重组BAC；(7)重组病毒的拯救；（8）生长曲线测定；B、构建Luciferase稳定表达系统：（1）设计扩增Luciferase-Hygr引物，（2）用高保真KOD酶扩增片段；（3）将pHSV-1BAC电转化到E.coliDY380中；（4）取回收的DNA片段电转化到pHSV-1BAC/DY380电转化感受态细胞中；（5）鉴定；（6）挑取DY380单克隆；（7）BAC质粒提取；（8）病毒拯救；（9）将HSV-1BACLuc重组病毒感染细胞，在体外对病毒进行半定量。方法易行，操作简便，既可在体外对病毒基因组进行修饰，又可在体外对病毒粒子进行半定量。

主权项

一种携带荧光素酶报告基因的HSV‑1 BAC系统的构建方法，其步骤是：A、构建HSV‑1 BAC系统：(1)根据HSV‑1 F株序列设计含HSV‑1 UL37和UL38同源臂和BAC载体序列的引物，其序列为：UL37 forward：TAggatccGAGCTGCAGCAGGCTGGAG；UL37reverse：CCGaagcttATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATAAGTGGCCGTATAACACCC；UL38forward：CGCaagcttATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATAAGTCCCGGCATCCCGTTCG；UL38 reverse：ATggatccGCCCAAACAGCCGCTCCAG；(2)构建转移载体pUSF6：a)用高保真酶KOD以及上述引物使用PCR扩增UL37和UL38臂，分别用回收试剂盒回收；UL37臂PCR产物经BamH I酶切后试剂盒回收，pBluescript SK+(pBSSK)载体用BamH I和EcoR V双酶切后试剂盒回收，上述片段经连接转化构建重组质粒pBSSK‑UL37，然后用Sac I酶切后用T4 DNA聚合酶补平，然后用BamH I酶切，回收后的片段与同样用BamH I酶切后回收的UL38臂片段连接，构建pBSSK‑UL37‑UL38质粒；b)BAC载体pUSF5用HindIII酶切后用碱性磷酸酶进行去磷酸化；pBSSK‑UL37‑UL38质粒经HindIII酶切后，通过1.5％质量体积比的琼脂糖凝胶电泳分离，切胶，试剂盒回收UL37‑UL38片段，与经CIP处理过的pUSF5载体进行连接，构建转移载体pUSF6；(3)构建HSV‑1 BAC重组病毒：a)将pUSF6用BamH I线性化，试剂盒回收；b)取2mg pUSF6用Lipofectamine 2000转染非洲绿猴肾细胞，然后用野生型F株HSV‑1(wt HSV‑1 F)进行感染，选择表达绿色荧光的噬斑即为重组型；(4)重组病毒的噬斑纯化：将绿色荧光的噬斑进行10、100、1000倍稀释后分别感染新鲜的单层Vero细胞，挑取只表达绿色荧光的噬斑，重复此过程2～3次直到最终病毒感染的细胞全部表达绿色荧光，为HSV‑1 BAC；(5)重组病毒的鉴定：以纯化的HSV‑1 BAC重组病毒感染Vero细胞，提取病毒基因组，然后用HindIII和EcoR I进行酶切鉴定；(6)构建穿梭型的重组BAC：a)扩增HSV‑1 BAC重组病毒，测定病毒滴度，以10m.o.i.的HSV‑1 BAC病毒感染Vero单层细胞2～3h后，刮取细胞，提取环状病毒基因组；b)环状病毒基因组经透析后，电转化到大肠杆菌DH10B电转化感受态细胞中，均匀涂在12.5mg/ml有氯霉素抗性的LB固体培养基上，37℃培养过夜；c)挑取单个克隆，37℃培养过夜，碱裂解法小量提取BAC质粒，经HindIII酶切分析，选择与预期条带相符的克隆作为候选克隆，为pHSV‑1 BAC；(7)vHSV‑1 BAC重组病毒的拯救：a)按照NucleoBond的BAC质粒提取试剂盒说明书，500ml过夜培养的菌液用于提取pHSV‑1 BAC质粒，最后用200μL ddH2O溶解；b)取1～2mg pHSV‑1 BAC电转染到Vero细胞中，2～3天后观察到表达绿色荧光的噬斑，为vHSV‑1 BAC；(8)BAC骨架的切除：取pHSV‑1 BAC质粒1～2mg与0.5mg的Cre重组酶表达质粒pGS403同时电转染到Vero细胞中，2～3天后观察到同时有表达绿色荧光和不表达绿色荧光的噬斑，用步骤(4)所描述的噬斑纯化方法纯化出不表达绿色荧光的病毒，为HSV‑1 lox；(9)野生型及重组病毒生长特性的鉴定：用噬斑检测法同时测定wt HSV‑1、HSV‑1 BAC、HSV‑1 lox和HSV‑1 BAC Luc病毒的一步生长曲线，结果各重组病毒和野生型病毒表现出几乎一致的生长曲线，表明BAC载体的插入并没有改变病毒的生长特性，这种构建的HSV‑1 BAC系统进一步用来对病毒基因组进行改造或修饰；B、构建Luciferase稳定表达的HSV‑1 BAC系统：(1)设计扩增Luciferase‑Hygr表达盒的PCR引物，引物5’端包含UL3与UL4基因间隔区的各40bp的序列，用于同源重组，引物3’端包含Luciferase‑Hygr表达盒19bp的序列，用于扩增Luciferase‑Hygr片段，其序列为：Luc‑Hyg forword：CCGAGATAACGTCATGCTGGCCTCGGGGGCCGAGTAACCGCGAGCTCTTACGCGTGCTALuc‑Hyg reverse：TGCCACCCCCCCTGCGGGCGGTCCATTAAAGACAACAAACTCAGGCGCCGGGGGCGGTG；(2)用高保真KOD酶以及上述引物PCR扩增Luciferase‑Hygr片段，用回收试剂盒回收， 回收后的片段用Dpn I消化后再次用试剂盒回收，双蒸水洗脱DNA片段；(3)将pHSV‑1 BAC电转化到E.coli DY380中，32℃培养24～48h，挑取单个克隆制备pHSV‑1 BAC/DY380电转化感受态细胞；(4)取回收的Luciferase‑Hygr DNA片段200ng电转化到pHSV‑1 BAC/DY380电转化感受态细胞中，涂在氯霉素和潮霉素双抗性的LB琼脂平板上32℃培养过夜；(5)挑取单个克隆用PCR进行鉴定，对PCR阳性的克隆用碱裂解法提取BAC质粒，然后用HindIII进行酶切鉴定，与预期条带相符的克隆作为候选克隆，为pHSV‑1 BAC Luc；(6)挑取pHSV‑1 BAC Luc/DY380单克隆，每天传代一次，连续传代20天，在传代后的2、4、6、8、10、12、14、16、18、20天分别提取其BAC DNA用HindIII酶切后进行限制性片段长度多态性分析；(7)按照NucleoBond的BAC质粒提取试剂盒说明书，500ml过夜培养的菌液用于提取pHSV‑1 BAC Luc质粒，取1～2mg pHSV‑1 BAC Luc质粒电转染到Vero细胞中，2～3天后观察绿色荧光噬斑的表达，为HSV‑1 BAC Luc；(8)将HSV‑1 BAC Luc重组病毒感染Vero细胞后，同时用噬斑检测法和荧光素酶检测试剂盒测定病毒的一步生长曲线，所构建的重组BAC系统用来在体外对病毒进行半定量。