一种用于短链RNA检测的欧米茄结构寡核苷酸引物及其应用

摘要

本发明公开了一种于短链RNA检测的欧米茄结构寡核苷酸引物，其从5’端至3’端依次为：20-30个碱基的PCR引物目标区、0-50碱基的可变编码区、欧米茄茎环、至少1个碱基的探针间隔区和4-11个碱基探针区，所述欧米茄茎环的茎的长度为4-12个配对的碱基，所述欧米茄茎环的环的长度为3-20个不配对的碱基，本发明的这种结构的引物可以避免链内启动和引物二聚体化，可以增加探针在3’末端目标杂交精确度，提高转录特异性和灵敏度，可以用较少的引物取得较高的RT效率和较好的特异性，同时在一个反应体系中可加入检测不同目标的多个引物，可以同时区分不同的检测目标而来的PCR产物，从而实现多通道高通量检测，大大提高了检测效率。

主权项

一种用于短链RNA检测的欧米茄结构寡核苷酸引物，其特征在于：其从5’端至3’端依次为：PCR引物目标区、可变编码区、欧米茄茎环、探针间隔区和探针区，其中，所述PCR引物目标区的长度为20‑30个碱基，所述可变编码区的长度为0‑50个碱基，所述欧米茄茎环的茎的长度为4‑12个配对的碱基，所述配对的碱基为顺式结构方式，所述欧米茄茎环的环的长度为3‑20个不配对的碱基，所述探针间隔区的长度为至少1个碱基，所述探针区的长度为4‑11个碱基。