发明名称 一种基于纳米钯标记的基因芯片显色方法
摘要 本发明公开了一种基于纳米钯标记的基因芯片显色方法,采用了纳米钯标记生物分子(如DNA、亲和素等),然后通过标记后的纳米钯对钴、铜、镍等金属的化学镀过程具有催化沉积作用进行显色,从而克服了以往“金标银染”过程中出现的系列缺点,达到显色过程可控、显色过程的非特异性沉积较少的目的。对于显色后的结果可以通过肉眼定性分析,亦可利用凝胶成像系统中的光学扫描仪进行灰度扫描,并结合相关软件对结果进行灰度值分析等定量研究,从而区别出探针与靶序列间的完全正配、错配一个碱基、错配两个碱基与完全错配。
申请公布号 CN102618637A 申请公布日期 2012.08.01
申请号 CN201210060708.7 申请日期 2012.03.09
申请人 东南大学 发明人 王志飞
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人 柏尚春
主权项 一种基于纳米钯标记的基因芯片显色方法,其特征在于包括如下步骤:(1)待测样品的基因提取、纯化、扩增与标记;(2)生物分子的纳米钯标记,根据后面检测过程的不同,分为两种生物分子的纳米钯标记:(2‑1)共用序列DNA‑纳米钯的制备:将一段5,(3,)端含巯基(‑SH)的共用DNA序列与纳米钯水溶液孵育12‑48小时,然后,离心清洗去除多余DNA;或者将一段5,(3,)端含胺基(‑NH2)的共用DNA序列与醛基或羧基修饰纳米钯反应,利用共价键将DNA连到纳米钯表面;(2‑2)亲和素或链亲和素‑纳米钯的制备:在EDC/NHS的帮助下,将亲和素或链亲和素连接到羧基修饰的纳米钯表面;(3)芯片的制备:先对玻璃载玻片表面进行清洗、去除污染物;接着,利用氨基硅烷化试剂在玻片表面修饰上氨基;随后,再通过戊二醛分子在玻片表面修饰醛基功能团;最后,根据检测样品的特点,利用点样仪将所设计的DNA探针点样到玻片表面进行固定;(4)芯片的杂交:先将步骤(1)获得的目标DNA分散在TE缓冲液中,然后按2∶1的关系将其与杂交母液混合,配成杂交液;接着,在杂交舱或盖玻片的帮助下,将杂交液覆盖在芯片表面进行生物分子反应0.5‑1.5小时,具体杂交温度取决于实验中待测样品中的G‑C含量与碱基个数;杂交完成后,利用清洗液,洗去多余的、非特异性吸附的DNA片段;(5)芯片表面的纳米钯标记,根据样品DNA标记方法的不同,采用两种不同标记纳米钯方法:(5‑1)样品DNA标记是利用共用DNA序列标记,则将以上得到的芯片再与共用DNA序列标记纳米钯进行二次杂交,杂交温度取决于共用DNA序列中的G‑C含量与碱基个数;杂交后,清洗去除游离的共用DNA序列标记纳米钯;(5‑2)样品DNA标记是利用生物素标记,则纳米钯标记的过程采用生物素‑亲和素系统,直接将亲和素修饰纳米钯溶液与上面得到的芯片在35‑38℃下,孵育反应0.5‑1.5小时,反应结束后,利用PBS缓冲液洗去多余的、未结合亲和素‑纳米钯颗粒;(6)显色反应:利用化学镀技术,将以上得到的芯片浸入含钴、铜、镍或其他金属离子的镀液中,进行化学镀反应;反应后,金属离子将围绕已修饰的钯 颗粒周围进行沉积,由于沉积的金属为黑颜色,所以,清洗后,直接通过肉眼就可以观察到最终的检测情况。
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