一种用于鉴别近交系小鼠的SNP分型方法

摘要

本发明涉及一种用于鉴别近交系小鼠的SNP分型方法，包括：(1)遗传标记的选择，平均覆盖21染色体的共45个SNP位点，并对这些位点设计引物和探针；(2)四组多重PCR，每组含10～12对PCR引物；(3)四组多重LDR，每组含10～12个位点特异性探针；(4)产物快速分离鉴定。本发明的SNP分型方案，仅需要45个SNP遗传位标就可用于近交系小鼠的分型和鉴定，不仅能减少反应次数和时间，而且操作简便迅速，能大大节约成本，对其分型和研究具有重要意义，为近交系小鼠的鉴定和分型提供了一种新的方法。

主权项

一种用于鉴别近交系小鼠的SNP分型方法，包括：(1)从NCB上选取分型所用遗传位标，21条染色体上挑选2‑3个SNP位点，分成四组；然后对位点用Primer3在线设计引物，引物大小为15‑25bp，Tm值为60℃，GC％为60.0；(2)将上述分成四组的SNP位点用软件设计探针，产物长度为75‑125bp，组内各探针长度依次相差2个bp以上；(3)进行多重PCR‑LDR反应，退火温度从50℃至65℃，跨度为3℃，根据琼脂糖电泳和ABI377测序电泳结果，最终确定最佳的退火温度；(4)以近交系为模板，在上述最佳退火温度下进行四组多重PCR‑LDR反应，分析377分型数据，并与NCBI上的SNP位点信息比较，完成近交系小鼠遗传质量监测与品系鉴定。